Предварительная обработка последовательности считывает данные с помощью различных функций. Фильтрация считывается на основе качества данных секвенирования и обрезки концов последовательностей. Выполните согласование штрих-кода (демультиплексирование), чтобы сгруппировать выборки на основе их штрих-кодов. Разделите объединенные данные последовательности парного конца на два отдельных файла. Вычислите статистику качества и визуализируйте такую информацию с помощью графиков контроля качества.
seqfilter | Отфильтровывайте последовательности на основе заданного критерия |
seqtrim | Обрезка последовательностей на основе заданного критерия |
seqsplit | Разделите последовательности на отдельные файлы на основе штрихкодов |
seqsplitpe | Разделите объединенные последовательности парного конца на отдельные файлы |
seqqcplot | Создайте графики контроля качества для последовательности и данных о качестве |
Визуализация данных NGS с помощью приложения Genomics Viewer
Используйте приложение Genomics Viewer, чтобы просмотреть данные выравнивания NGS для одиночных нуклеотидных изменений в гене цитохрома p450.
