Класс: BioMap
Извлеките счета качества сопоставления последовательностей из BioMap объект
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj)
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj, Subset)
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj)MappingQualityвектор из целых чисел, задающий счета качества отображения для каждой последовательности чтения в BioObj, а BioMap объект.
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj, Subset)Subset.
|
Объект |
|
Одно из следующих для задания подмножества элементов в
Примечание Если для задания используется массив ячеек с заголовками |
|
|
Создайте a BioMap и затем извлеките счета качества отображения для различных элементов объекта:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the mapping quality property of the second element in
% the object
MQ_2 = getMappingQuality(BMObj1, 2)MQ_2 = 99
% Retrieve the mapping quality properties of the first and third % elements in the object MQ_1_3 = getMappingQuality(BMObj1, [1 3])
MQ_1_3 = 99 99
% Retrieve the mapping quality properties of all elements in the % object MQ_All = getMappingQuality(BMObj1);
Альтернатива использованию getMappingQuality метод состоит в том, чтобы использовать индексацию через точку с MappingQuality свойство:
BioObj.MappingQuality(Indices)
В предыдущем синтаксисе Indices - вектор положительных целых чисел или логический вектор. Indices не может быть массивом ячеек из векторов символов или строковым вектором, содержащим заголовки последовательностей.