getReference

Класс: BioMap

Извлечение ссылочной последовательности из BioMap объект

Синтаксис

Ref = getReference(BioObj)

Описание

Ref = getReference(BioObj) возвращает имя ссылочной последовательности из BioMap объект. Это значение по Reference свойство объекта.

Входные параметры

BioObj

Объект BioRead или BioMap класс.

Выходные аргументы

Ref

Reference свойство BioObj, BioMap объект. Это вектор символов или строковый вектор, задающий имя ссылочной последовательности.

Примеры

Создайте a BioMap объект, а затем извлеките ссылочную последовательность из объекта:

% Construct a BioMap object from a SAM file 
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the reference sequence from the object
refSeq = getReference(BMObj1)
refSeq =

seq1

Альтернативы

Альтернатива использованию getReference метод состоит в том, чтобы использовать индексацию через точку с Reference свойство:

BioObj.Reference
Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте