Класс: BioMap
Извлеките начальные положения выровненных последовательностей чтения из BioMap объект
Start = getStart(BioObj)
Start = getStart(BioObj, Subset)
Start = getStart(BioObj)Startвектор из целых чисел, задающий начальное положение выровненных последовательностей чтения относительно чисел позиций в ссылочной последовательности от a BioMap объект.
Start = getStart(BioObj, Subset)Subset.
|
Объект |
|
Одно из следующих для задания подмножества элементов в
Примечание Если для задания используется массив ячеек с заголовками |
|
|
Создайте a BioMap и затем извлеките начальное положение для различных последовательностей в объекте:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the start property of the second element in the object
Start_2 = getStart(BMObj1, 2)Start_2 =
3% Retrieve the start properties of the first and third elements in % the object Start_1_3 = getStart(BMObj1, [1 3])
Start_1_3 =
1
5% Retrieve the start properties of all elements in the object Start_All = getStart(BMObj1);
Альтернатива использованию getStart метод состоит в том, чтобы использовать индексацию через точку с Start свойство:
BioObj.Start(Indices)
В предыдущем синтаксисе Indices - вектор положительных целых чисел или логический вектор. Indices не может быть массивом ячеек из векторов символов или строковым вектором, содержащим заголовки последовательностей.