getHeader

Извлечение заголовков последовательности из объекта

Свернуть все на странице

Синтаксис

headers = getHeader(object)
subsetHeaders = getHeader(object,subset)

Описание

пример

headers = getHeader(object) возвращает последовательность headers (имена) из BioRead или BioMap объект.

пример

subsetHeaders = getHeader(object,subset) возвращает информацию о заголовке subsetHeaders только для элементов объекта, заданных в subset.

Примеры

свернуть все

Открыть Live Script

Сохраните считанные данные из файла в формате SAM в объекте BioRead.

br = BioRead('ex1.sam')
br = 
  BioRead with properties:

     Quality: [1501x1 File indexed property]
    Sequence: [1501x1 File indexed property]
      Header: [1501x1 File indexed property]
       NSeqs: 1501
        Name: ''

Получение информации о заголовке последовательности.

allHeaders = getHeader(br);

Извлеките информацию заголовка последовательности из первого и третьего элементов объекта.

subset = getHeader(br,[1 3])
subset = 2x1 cell
    {'B7_591:4:96:693:509'}
    {'EAS51_64:8:5:734:57'}

Используйте логический вектор, чтобы получить ту же информацию.

subset2 = getHeader(br,[true false true])
subset2 = 2x1 cell
    {'B7_591:4:96:693:509'}
    {'EAS51_64:8:5:734:57'}

Доступ к каждому свойству объекта с помощью записи через точку.

allHeaders  = br.Header;
subset      = br.Header([1 3])
subset = 2x1 cell
    {'B7_591:4:96:693:509'}
    {'EAS51_64:8:5:734:57'}

Входные параметры

свернуть все

Объект, содержащий считанные данные, заданный как BioRead или BioMap объект.

Пример: bioreadObj

Подмножество элементов объекта, заданное как вектор положительных целых чисел, логический вектор, строковый вектор или массив ячеек из векторов символов, содержащих допустимые заголовки последовательностей.

Пример: [1 3]

Выходные аргументы

свернуть все

Заголовки последовательности, возвращенные как массив ячеек из векторов символов.

Заголовки последовательности для подмножества элементов из объекта, возвращенные как массив ячеек из векторов символов.

См. также

|

Темы

Введенный в R2010a

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте