Exponenta Banner

getKeys

Класс: BioIndexedFile

Извлечение алфавитно-цифровых ключей из исходного файла, связанного с объектом BioIndexedFile

Синтаксис

Keys = getKeys(BioIFobj)

Описание

Keys = getKeys(BioIFobj) возвращает Keys, массив ячеек из векторов символов, задающий все ключи к записям в исходном файле, сопоставленном с BioIFobj, объект BioIndexedFile. Ключи появляются в том же порядке, что и в исходном файле, даже если они не уникальны.

Входные параметры

BioIFobj

Объект BioIndexedFile класс.

Выходные аргументы

Keys

Массив ячеек из символьных векторов, задающий все ключи к записям в исходном файле. Ключи появляются в том же порядке, что и в исходном файле, даже если они не уникальны.

Примеры

Создайте объект BioIndexedFile для доступа к таблице, содержащей перекрестные ссылки между именами генов и терминами онтологии генов (GO):

% Create variable containing full absolute path of source file
sourcefile = which('yeastgenes.sgd');
% Create a BioIndexedFile object from the source file. Indicate
% the source file is a tab-delimited file where contiguous rows
% with the same key are considered a single entry. Store the
% index file in the Current Folder. Indicate that keys are
% located in column 3 and that header lines are prefaced with !
gene2goObj = BioIndexedFile('mrtab', sourcefile, '.', ...
                            'KeyColumn', 3, 'HeaderPrefix','!')

Найдите все ключи для записей в исходном файле, а затем просмотрите первые 12 ключей:

% Retrieve all keys for entries in gene2goObj
keys = getKeys(gene2goObj);
% View the first 12 keys
keys(1:12)
ans = 

    '15S_RRNA'
    '21S_RRNA'
    'AAC1'
    'AAC3'
    'AAD10'
    'AAD14'
    'AAD15'
    'AAD16'
    'AAD3'
    'AAD4'
    'AAD6'
    'AAH1'

Совет

Используйте этот метод, чтобы увидеть полный список алфавитно-цифровых ключей, в том порядке, в котором они происходят в исходном файле, из которого был создан объект BioIndexedFile.

См. также

| | |

Темы

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка