Exponenta Banner
exponenta event banner

name property

Класс: термин

Вектор символов только для чтения, представляющий имя термина GO

Описание

name является свойством класса term только для чтения. name - вектор символов, представляющий имя термина GO.

Значения

Возможными значениями являются любое имя, используемое для термина в базе данных Gene Ontology. Используйте name свойство для определения имен объектов терминов или для доступа или фильтрации объектов терминов по наименованию.

Примеры

Пример 85. Использование имени Свойство для определения имени термина Объект

  1. Загрузите текущую версию базы данных Gene Ontology из Web в объект генеонта в MATLAB® программное обеспечение.

    GeneontObj = geneont('LIVE', true)

    MATLAB создает объект geneont и отображает количество объектов терминов, связанных с объектом geneont. 

    Gene Ontology object with 27769 Terms.

  2. Отобразите имя объекта термина на 157-й позиции в объекте генеонта, GeneontObj.

    GeneontObj.terms(157).name

ans =

  cytosolic small ribosomal subunit

Совет

Если вы знаете идентификатор GO (для примера, 181) объекта термина, вместо его индекса или номера позиции (для примера, 157), можно использовать следующий синтаксис, чтобы отобразить имя объекта термина:

GeneontObj(181).terms.name

Для получения помощи в преобразовании индекса или номера позиции объекта термина в его идентификатор GO, смотрите term.id свойство.

Пример 86. Использование имени Свойство для поиска и отображения Определенный термин Объекты

  1. Найдите индекс или номер позиции объекта термина, чья name свойство 'membrane'.

    membrane_index = find(strcmp(get(GeneontObj.terms,'name'),'membrane'))

membrane_index =

        9556

  2. Используйте этот индекс или номер позиции и id свойство для определения идентификатора GO объекта термина.

    membrane_goid = GeneontObj.terms(membrane_index).id

membrane_goid =

       16020

  3. Используйте этот идентификатор GO как вход в getrelatives метод для поиска идентификаторов GO других объектов термина, которые являются непосредственными родственниками объекта термина, чья name свойство 'membrane'.

    relative_ids = getrelatives(GeneontObj,membrane_goid)

relative_ids =

        5628
        5886
       16020
       19867
       30673
       31090
       34045
       34357
       42175
       42622
       42734
       44464
       45211
       48475
       60342

  4. Перечислите name свойства этих объектов термина. 

    get(GeneontObj(relative_ids).terms,'name')

ans = 

    'prospore membrane'
    'plasma membrane'
    'membrane'
    'outer membrane'
    'axolemma'
    'organelle membrane'
    'pre-autophagosomal structure membrane'
    'photosynthetic membrane'
    'nuclear envelope-endoplasmic reticulum network'
    'photoreceptor outer segment membrane'
    'presynaptic membrane'
    'cell part'
    'postsynaptic membrane'
    'coated membrane'
    'photoreceptor inner segment membrane'

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка