view (phytree)

Просмотрите филогенетическое дерево

Синтаксис

view(Tree)
view(Tree, IntNodes)

Аргументы

Tree

Филогенетическое дерево (phytree объект) созданный с функцией phytree.

IntNodes

Узлы от phytree возразите, чтобы первоначально отобразиться в Tree.

Описание

view(Tree) открывает окно Phylogenetic Tree и чертит дерево из данных в phytree объект (Tree). Значительные расстояния между ветвями и узлами находятся в горизонтальном направлении. Вертикальные расстояния не имеют никакого значения и выбраны только в целях отображения. Можно получить доступ к инструментам, чтобы отредактировать и анализировать дерево из панели меню Phylogenetic Tree или при помощи левых и правых кнопок мыши.

view(Tree, IntNodes) открывает окно Phylogenetic Tree с начальным выбором узлов, заданных IntNodes. IntNodes может быть логический массив любого из следующих размеров: NumLeaves + NumBranches x 1, NumLeaves x 1, или NumBranches x 1. IntNodes может также быть список индексов.

Примеры

свернуть все

Загрузите и просмотрите демонстрационное филогенетическое дерево.

tr = phytreeread('pf00002.tree');
view(tr)

Представлено до R2006a