Модель SimBiology в виде SimBiology model object. Активное configset object из модели содержит настройки решателя для симуляции. Любые активные дозы и варианты применяются к модели в процессе моделирования, если не задано в противном случае использование dosing и variants входные параметры, соответственно.

Данные, чтобы соответствовать в виде a groupedData object.

Имя переменной времени должно быть задано в IndependentVariableName свойство grpData. Например, если именем переменной времени является 'TIME', затем задайте его можно следующим образом.

grpData.Properties.IndependentVariableName = 'TIME';

grpData должен иметь по крайней мере две группы, и имя имени сгруппированной переменной должно быть задано в GroupVariableName свойство grpData. Например, если именем сгруппированной переменной является 'GROUP', затем задайте его можно следующим образом.

grpData.Properties.GroupVariableName = 'GROUP';

Отображение информации компонентов модели к grpDataВ виде вектора символов, строки, вектора строки или массива ячеек из символьных векторов.

Каждый вектор символов или строка являются подобным уравнению выражением, похожим на правила присвоения в SimBiology. Это содержит имя (или полностью определенное имя) количества (разновидности, отсек или параметр) или observable объект в модели sm, сопровождаемый символьным '=' и имя переменной в grpData. Для ясности пробелы позволены между именами и '='.

Например, если у вас есть данные о концентрации 'CONC' в grpData для разновидности 'Drug_Central', можно задать его можно следующим образом.

ResponseMap = 'Drug_Central = CONC';

Чтобы назвать разновидность однозначно, используйте полностью определенное имя, которое включает имя отсека. Чтобы назвать ограниченный по объему реакцией параметр, используйте имя реакции, чтобы квалифицировать параметр.

Если имя компонента модели или grpData именем переменной не является допустимый MATLAB^® имя переменной, окружите его квадратными скобками, такими как:

ResponseMap = '[Central 1].Drug = [Central 1 Conc]';

Если само имя переменной содержит квадратные скобки, вы не можете использовать его в выражении, чтобы задать информацию об отображении.

Ошибка выпущена, если какое-либо (квалифицированное) имя совпадает с двумя компонентами того же типа. Однако можно использовать (квалифицированное) имя, которое совпадает с двумя компонентами различных типов, и функция сначала находит разновидности с именем, сопровождаемым отсеками и затем параметрами.

Предполагаемые параметры в виде вектора из estimatedInfo объекты или a CovariateModel object это задает предполагаемые параметры в модели sm, их (дополнительные) первоначальные оценки, и их отношение к специфичным для группы ковариантам включены в grpData (дополнительный). Если это - вектор из estimatedInfo объекты, затем никакие коварианты не используются, и все параметры оцениваются со специфичными для группы случайными эффектами.

Можно также задать преобразования параметра при необходимости. Поддерживаемыми преобразованиями является log, logit, и probit. Для получения дополнительной информации смотрите EstimatedInfo object и CovariateModel object.

Если covEstiminfo вектор из estimatedInfo объекты, CategoryVariableName свойство каждого из этих объектов проигнорировано.

Информация о дозах в виде пустого массива ([] или {}), 2D матрица или вектор ячейки из объектов дозы (ScheduleDose object или RepeatDose object).

Если вы не используете dosing введите, функция применяет активные дозы модели, если существует кто-либо.

Если вы задаете вход как пустой [] или {}, никакие дозы не применяются в процессе моделирования, даже если модель имеет активные дозы.

Для матрицы объектов дозы это должно иметь одну строку или одну строку на группу во входных данных. Если это имеет одну строку, те же дозы применяются ко всем группам в процессе моделирования. Если это имеет несколько строк, каждая строка применяется к отдельной группе в том же порядке, как группы появляются во входных данных. Несколько столбцов позволены так, чтобы можно было применить несколько объектов дозы к каждой группе.

Для вектора ячейки из доз это должно иметь один элемент или один элемент на группу во входных данных. Каждым элементом должен быть [] или вектор из доз. Каждый элемент ячейки применяется к отдельной группе в том же порядке, как группы появляются во входных данных.

В дополнение к ручному построению использования объектов дозы sbiodose, если вход groupedData объект имеет информацию о дозах, можно использовать createDoses метод, чтобы создать дозы.

Имя функции оценки в виде вектора символов или строки. Выбором является 'nlmefit' или 'nlmefitsa'. Поскольку сводные данные поддержали методы и подходящие опции, см. Поддерживаемые Методы для Оценки Параметра SimBiology.

Опции, характерные для оценки, функционируют в виде структуры.

Структура может содержать поля и значения по умолчанию, которые являются аргументами name-value, принятыми nlmefit (Statistics and Machine Learning Toolbox) и nlmefitsa (Statistics and Machine Learning Toolbox), кроме следующих, которые не поддерживаются.

'REParamsSelect' только поддерживается, когда вы обеспечиваете вектор из estimatedInfo объекты при определении предполагаемых параметров.

Используйте statset (Statistics and Machine Learning Toolbox) функция только, чтобы установить 'Options' поле структуры (opt), можно следующим образом.

opt.Options = statset('Display','iter','TolX',1e-3,'TolFun',1e-3);

Для других поддерживаемых аргументов name-value (см. nlmefit (Statistics and Machine Learning Toolbox) и nlmefitsa (Statistics and Machine Learning Toolbox)), устанавливает их можно следующим образом.

opt.ErrorModel = 'proportional';
opt.ApproximationType = 'LME';

Варианты в виде пустого массива ([] или {}) или вектор из различных объектов.

Если вы