Сетевой анализ и визуализация

Примените основные алгоритмы теории графов к Взаимодействиям белка белка (PPI) и другим генным сетям; просмотрите сетевые отношения с помощью интерактивных карт, графиков иерархии и трасс

Используйте различные алгоритмы графика, чтобы анализировать генные сети и взаимодействия белка белка. Представляйте различные типы графиков с помощью разреженных матриц. Визуализируйте графики и сетевые отношения с помощью biograph объект, который позволяет вам вычислить положение узлов, чертит график и находит отношения между узлами.

Функции

graphallshortestpathsНайдите все кратчайшие пути в графике
graphconncompНайдите строго или слабо соединенные компоненты в графике
graphisdagПротестируйте на циклы в ориентированном графе
graphisomorphismНайдите изоморфизм между двумя графиками
graphisspantreeОпределите, охватывает ли дерево дерево
graphmaxflowВычислите максимальный поток в ориентированном графе
graphminspantreeНайдите минимальное дерево охвата в графике
graphpred2pathПреобразуйте индексы-предшественников в пути
graphshortestpathРешите задачу кратчайшего пути в графике
graphtopoorderВыполните топологический вид направленного графа без петель
graphtraverseПересеките график следующими смежными узлами

Классы

biographСоздайте биообъект диаграмм
biograph objectСтруктура данных, содержащая типовые взаимосвязанные данные раньше, реализовывала ориентированного графа

Темы

Функции теории графов

Функции теории графов в Bioinformatics Toolbox™ применяют основные алгоритмы теории графов к разреженным матрицам.

Визуализация графика

Bioinformatics Toolbox включает функции, объекты и методы для создания, просмотра и управления графиками, такими как интерактивные карты, графики иерархии и трассы.

Рекомендуемые примеры

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте