Сетевой анализ и визуализация
Примените основные алгоритмы теории графов к Взаимодействиям белка белка (PPI) и другим генным сетям; просмотрите сетевые отношения с помощью интерактивных карт, графиков иерархии и трасс
Используйте различные алгоритмы графика, чтобы анализировать генные сети и взаимодействия белка белка. Представляйте различные типы графиков с помощью разреженных матриц. Визуализируйте графики и сетевые отношения с помощью biograph объект, который позволяет вам вычислить положение узлов, чертит график и находит отношения между узлами.
Функции
graphallshortestpaths | Найдите все кратчайшие пути в графике |
graphconncomp | Найдите строго или слабо соединенные компоненты в графике |
graphisdag | Протестируйте на циклы в ориентированном графе |
graphisomorphism | Найдите изоморфизм между двумя графиками |
graphisspantree | Определите, охватывает ли дерево дерево |
graphmaxflow | Вычислите максимальный поток в ориентированном графе |
graphminspantree | Найдите минимальное дерево охвата в графике |
graphpred2path | Преобразуйте индексы-предшественников в пути |
graphshortestpath | Решите задачу кратчайшего пути в графике |
graphtopoorder | Выполните топологический вид направленного графа без петель |
graphtraverse | Пересеките график следующими смежными узлами |
Классы
biograph | Создайте биообъект диаграмм |
biograph object | Структура данных, содержащая типовые взаимосвязанные данные раньше, реализовывала ориентированного графа |
Темы
Функции теории графов в Bioinformatics Toolbox™ применяют основные алгоритмы теории графов к разреженным матрицам.
Bioinformatics Toolbox включает функции, объекты и методы для создания, просмотра и управления графиками, такими как интерактивные карты, графики иерархии и трассы.
