Класс: GFFAnnotation
Получите имена уникальной функции из GFFAnnotation
объект
Features = getFeatureNames(AnnotObj)
возвращает Features
= getFeatureNames(AnnotObj
)Features
, массив ячеек из символьных векторов, задающий имена уникальной функции, сопоставлен с аннотациями в AnnotObj
.
|
Объект |
|
Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена уникальной функции, сопоставлен с аннотациями в |
Создайте a GFFAnnotation
объект из GFF-отформатированного файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем получает имена функции из объекта аннотации:
% Construct a GFFAnnotation object from a GFF file GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff'); % Retrieve feature names for the annotation object featureNames = getFeatureNames(GFFAnnotObj)
featureNames = 'CDS' 'exon' 'five_prime_UTR' 'gene' 'mRNA' 'miRNA' 'ncRNA' 'protein' 'pseudogene' 'pseudogenic_exon' 'pseudogenic_transcript' 'tRNA' 'three_prime_UTR' 'transposable_element_gene'
getData (GFFAnnotation)
| getFeatureNames (GFFAnnotation)
| getIndex (GFFAnnotation)
| getRange (GFFAnnotation)
| getReferenceNames (GFFAnnotation)
| getSubset (GFFAnnotation)
| GFFAnnotation
| GTFAnnotation