Класс: GFFAnnotation
Возвратите массив индекса аннотаций от GFFAnnotation объект
Idx = getIndex(AnnotObj)
Idx = getIndex(AnnotObj,StartPos,EndPos)
Idx = getIndex(___,Name,Value)
Idx = getIndex(AnnotObj)Idx, массив целых чисел, содержащих индекс каждой аннотации в AnnotObj.
Idx = getIndex(AnnotObj,StartPos,EndPos)Idx для подмножества элементов, которое находится в пределах каждого ссылочного диапазона последовательности, указанного StartPos и EndPos.
Idx = getIndex(___,Name,Value)Idx, использование любого из входных параметров от предыдущих синтаксисов и дополнительных опций задано одним или несколькими Name,Value парные аргументы.
|
Объект |
|
Неотрицательное целое число, задающее запуск области значений в каждой ссылочной последовательности в |
|
Неотрицательное целое число, задающее конец области значений в каждой ссылочной последовательности в |
Задайте дополнительные разделенные запятой пары Name,Value аргументы. Name имя аргумента и Value соответствующее значение. Name должен появиться в кавычках. Вы можете задать несколько аргументов в виде пар имен и значений в любом порядке, например: Name1, Value1, ..., NameN, ValueN.
|
Вектор символов или массив ячеек из символьных векторов, задающий одну или несколько ссылочных последовательностей в |
|
Вектор символов или массив ячеек из символьных векторов, задающий одну или несколько функций в |
|
Минимальное количество основных положений, которые аннотация должна перекрыть в области значений, чтобы включать ее индекс в
Значение по умолчанию: |
|
Массив целых чисел, представляющих индексы элементов в |
Создайте a GFFAnnotation объект с помощью GFF-отформатированного файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™.
GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff');
Извлеките индексы аннотаций или функций положений 10 000 - 20 000 от ссылочной последовательности.
Idx = getIndex(GFFAnnotObj,10000,20000)
Idx =
61
62
63
64
65
66
67
68
69getData (GFFAnnotation) | getFeatureNames (GFFAnnotation) | getIndex (GFFAnnotation) | getRange (GFFAnnotation) | getReferenceNames (GFFAnnotation) | getSubset (GFFAnnotation) | GFFAnnotation | GTFAnnotation