Класс: GFFAnnotation
Получите область значений аннотаций от GFFAnnotation
объект
Range = getRange(AnnotObj)
возвращает Range
= getRange(AnnotObj
)Range
, 1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охвачен аннотациями в AnnotObj
.
|
Объект |
|
1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охвачен аннотациями в |
Создайте a GFFAnnotation
объект из GFF-отформатированного файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем возвращает область значений аннотаций функции:
% Construct a GFFAnnotation object from a GFF file GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff'); % Return first and last positions of reference associated with feature annotations range = getRange(GFFAnnotObj)
range = 3631 498516
Используйте getSubset
метод с Reference
пара "имя-значение", чтобы возвратить a GFFAnnotation
объект, содержащий только одну ссылочную последовательность. Затем используйте этот объект из подмножества, как введено для getRange
метод.
getData (GFFAnnotation)
| getFeatureNames (GFFAnnotation)
| getIndex (GFFAnnotation)
| getRange (GFFAnnotation)
| getReferenceNames (GFFAnnotation)
| getSubset (GFFAnnotation)
| GFFAnnotation
| GTFAnnotation