Считывание данных последовательности предварительной обработки с использованием различных функций. Фильтр считывает на основе качества данных секвенирования и обрезки концов последовательностей. Выполните сопоставление штрих-кодов (демультиплексирование) для группирования образцов на основе их штрих-кодов. Разделение объединенных данных парной последовательности на два отдельных файла. Расчет статистики качества и визуализация такой информации с использованием графиков контроля качества.
seqfilter | Фильтрация последовательностей на основе заданного критерия |
seqtrim | Последовательности обрезки на основе указанного критерия |
seqsplit | Разделение последовательностей на отдельные файлы на основе штрихкодов |
seqsplitpe | Разделение объединенных парных последовательностей на отдельные файлы |
seqqcplot | Создание графиков контроля качества для данных последовательности и качества |
Визуализация данных NGS с помощью приложения Genomics Viewer
Используйте приложение Genomics Viewer для просмотра данных выравнивания NGS для однонуклеотидных вариаций в гене цитохрома p450.