Exponenta Banner
exponenta event banner

clusterGroup

Выбор группы кластеров

свернуть все на странице

Синтаксис

clusterGroup (cgObj1,groupIndex,dim)
cgObj2 = clusterGroup (cgObj1,groupIndex,dim)
cgObj2 = clusterGroup (cgObj1, groupIndex, dim, 'InfoOnly', tf _ InfoOnly)
cgObj2 = clusterGroup (cgObj1, groupIndex, dim, 'Цвет', colorChoice)

Описание

пример

clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim) выбирает и выделяет группу кластера, указанную groupIndex вдоль размера строки или столбца dim в окне Clustergram.

пример

cgObj2 = clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim) создает и возвращает объект clustergram cgObj2 для указанной группы кластеров. Этот синтаксис эквивалентен выбору Export Group to Workspace в контекстном меню после щелчка правой кнопкой мыши по группе в окне Clustergram.

cgObj2 = clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim,'InfoOnly',tf_InfoOnly) указывает, следует ли возвращать группу кластера в виде структуры или объекта кластерграммы.

cgObj2 = clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim,'Color',colorChoice) указывает цвет, используемый для выделения дендрограммы выбранной группы кластера.

Примеры

свернуть все

Загрузить данные микрочипов, содержащие некоторые измерения уровней экспрессии генов.

load filteredyeastdata

Создайте объект clustergram и отобразите тепловую карту из данных экспрессии генов.

cgo = clustergram(yeastvalues(1:30,:),'Standardize','Row')
Clustergram object with 30 rows of nodes and 7 columns of nodes.

В командной строке используйте команду clusterGroup для выбора и выделения кластера столбцов группы 4 в окне Clustergram.

cgroup4 = clusterGroup(cgo,4,'column')
Clustergram object with 30(30) rows of nodes and 4(7) columns of nodes.

Входные аргументы

свернуть все

Объект Clustergram, указанный как clustergram объект.

Индекс группы для группы кластера в cgObj1, указано как положительное целое число.

Пример: 4

Типы данных: double

Измерение группы кластеров, указанное как 'row' или 'column'.

Пример: 'row'

Типы данных: char

Флаг для возврата структуры вместо объекта clustergram, указанного как true или false.

Пример: true

Типы данных: logical

Цвет для выделения дендрограммы выбранной группы кластера, заданной как символьный вектор или трехэлементный числовой вектор значений RGB. Например, для использования голубого укажите [0 1 1], 'c', или 'cyan'.

Дополнительные сведения об указании цветов см. в разделе Параметры цвета.

Пример: 'red'

Типы данных: double | char

Выходные аргументы

свернуть все

Выбранная группа кластера, возвращенная как объект или структура кластера. При указании 'InfoOnly' как true, функция возвращает cgObj2 как структура.

Подробнее

свернуть все

Параметры цвета

Ниже перечислены предопределенные цвета и их эквиваленты RGB-триплетов. Краткие и длинные имена являются векторами символов, задающими один из восьми заданных цветов. Триплет RGB представляет собой трехэлементный вектор строки, элементы которого задают интенсивности красной, зеленой и синей составляющих цвета; интенсивности должны находиться в диапазоне [0 1].

Триплет RGB

Краткое имя

Длинное имя

[1 1 0]

y

yellow

[1 0 1]

m

magenta

[0 1 1]

c

cyan

[1 0 0]

r

red

[0 1 0]

g

green

[0 0 1]

b

blue

[1 1 1]

w

white

[0 0 0]

k

black

См. также

|

Представлен в R2009b

Документация по инструментарию биоинформатики

Поддержка