Exponenta Banner
exponenta event banner

fastainfo

Возврат информации о файле FASTA

свернуть все на странице

Синтаксис

info = fastainfo (файл)
info = fastainfo (файл, «TimeOut», распоряжение о перемещении материалов)

Описание

пример

info = fastainfo(file) возвращает структуру info содержит сводную информацию о FASTA file.

пример

info = fastainfo(file,'TimeOut',TO) задает время ожидания подключения (в секундах) для чтения данных из удаленного файла или URL-адреса.

Примеры

свернуть все

Открыть сценарий в реальном времени
info = fastainfo('ex1ref.fasta')
info = struct with fields:
           Filename: 'ex1ref.fasta'
           FilePath: '/mathworks/devel/bat/BR2021ad/build/matlab/toolbox/bioinfo/bioinfodata'
        FileModDate: '07-May-2010 16:12:06'
           FileSize: 1612
    NumberOfEntries: 1
             Header: 'Reference for ex1'
             Length: 1569

Входные аргументы

свернуть все

Файл FASTA, указанный как один из следующих:

  • Символьный вектор или строка, указывающая имя файла FASTA, путь и имя файла FASTA или URL-адрес, указывающий на файл FASTA. Если указано только имя файла, файл должен находиться в пути поиска MATLAB ® или в текущей папке.

  • Символьный массив, содержащий текст файла FASTA.

Типы данных: char | string

Тайм-аут подключения для чтения данных из удаленного файла, указанного как положительный скаляр. Подробнее см. здесь.

Типы данных: double
Поддержка комплексного номера: Да

Выходные аргументы

свернуть все

Сводная информация о файле FASTA, возвращенная в виде структуры. Структура содержит следующие поля.

ОбластьОписание

Filename

Имя файла.

FilePath

Путь к файлу.

FileModDate

Дата изменения файла.

FileSize

Размер файла в байтах.

NumberOfEntries

Количество записей последовательности в файле.

Header

Если file содержит только одну последовательность, то это символьный вектор, содержащий информацию заголовка из файла FASTA. В противном случае это поле пусто.

Length

Если file содержит только одну последовательность, то это скаляр, задающий длину последовательности. В противном случае это поле пусто.

См. также

| | | |

Темы

Представлен в R2009b

Документация по инструментарию биоинформатики

Поддержка