Exponenta Banner
exponenta event banner

fastqinfo

Возврат информации о файле FASTQ

Синтаксис

InfoStruct = fastqinfo(File)

Описание

InfoStruct = fastqinfo(File) возвращает структуру MATLAB ®, содержащую сводную информацию о файле в формате FASTQ.

Входные аргументы

File

Символьный вектор или строка, указывающая имя файла или путь и имя файла в формате FASTQ. Если указано только имя файла, он должен находиться в пути поиска MATLAB или в текущей папке.

Выходные аргументы

InfoStruct

Структура MATLAB содержит сводную информацию о файле в формате FASTQ. Структура содержит следующие поля.

ОбластьОписание
FilenameИмя файла.
FilePathПуть к файлу
FileModDateДата изменения файла.
FileSizeРазмер файла в байтах.
NumberOfEntries Количество операций чтения последовательности в файле.

Примеры

Возвращает сводку содержимого файла FASTQ:

info = fastqinfo('SRR005164_1_50.fastq')

info = 

           Filename: 'SRR005164_1_50.fastq'
           FilePath: 'D:\2010_08_24_h11m43s32_job6027_pass\matlab\toolbox\bioinfo\biodemos'
        FileModDate: '03-Mar-2009 14:21:51'
           FileSize: 16702
    NumberOfEntries: 50

См. также

| | | | | | | | | | |

Темы

Внешние веб-сайты

Представлен в R2009b

Документация по инструментарию биоинформатики

Поддержка