Извлечь филогенетическое поддерево
Tree2 = subtree(Tree1, Nodes)
Tree2 = subtree(Tree1, Nodes)Tree2), где новый корень является первым общим предком Nodes вектор из Tree1. Узлы в дереве индексируются как [1:NUMLEAVES] для листьев и [NUMLEAVES+1:NUMLEAVES+NUMBRANCHES] для ветвей. Узлы также могут быть логическим массивом следующих размеров [NUMLEAVES+NUMBRANCHES x 1], [NUMLEAVES x 1] или [NUMBRANCHES x 1].
Загрузите филогенетическое дерево, созданное из семейства белков.
tr = phytreeread('pf00002.tree');Получить поддерево, которое содержит VIPR2 и GLR человеческие белки.
sel = getbyname(tr,{'vipr2_human','glr_human'});
sel = any(sel,2);
tr = subtree(tr,sel);
view(tr)