Exponenta Banner

sampleNames

Класс: bioma.data.MetaData
Пакет: bioma.data

Извлечение или задание имен выборок в объекте MetaData

Синтаксис

SamFeatNames = sampleNames(MDObj)
SamFeatNames = sampleNames(MDObj, Subset)
NewMDObj = sampleNames(MDObj, Subset, NewSamFeatNames)

Описание

SamFeatNames = sampleNames(MDObj) возвращает массив ячеек из векторов символов, задающий все имена выборок в объекте MetaData.

SamFeatNames = sampleNames(MDObj, Subset) возвращает массив ячеек из векторов символов, задающий подмножество имен выборок в объекте MetaData.

NewMDObj = sampleNames(MDObj, Subset, NewSamFeatNames) заменяет имена выборок, заданные как Subset в MDObj, объект MetaData с NewSamFeatNames, и возвращает NewMDObj, новый объект MetaData.

Входные параметры

MDObj

Объект bioma.data.MetaData класс.

Subset

Одно из следующих действий для задания подмножества имен выборок в объекте MetaData:

  • Вектор символов, задающий имя выборки

  • Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена выборок

  • Положительное целое число

  • Вектор положительных целых чисел

  • Логический вектор

NewSamFeatNames

Новые имена выборок для определенных имен в объекте MetaData, заданные одним из следующих:

  • Числовой вектор

  • Массив ячеек из символьных векторов или символьного массива

  • Вектор символов, который sampleNames использует в качестве префикса для выборки или имен функций с номерами, добавленными к префиксу

  • Логический true или false (по умолчанию). Если true, sampleNames присваивает уникальные имена в формате Sample1, Sample2, и т.д.

Количество имен в NewSamFeatNames должно равняться количеству выборок, заданному в Subset.

Выходные аргументы

SamFeatNames

Массив ячеек из символьных векторов, задающий все или некоторые имена выборок в объекте MetaData. Выборки также являются именами строк VarValues массив набора данных в объекте MetaData.

NewMDObj

Объект bioma.data.MetaData класс, возвращенный после замены определенных имен выборок.

Примеры

Создайте объект MetaData, а затем получите из него имена выборок:

% Import bioma.data package to make constructor function
% available
import bioma.data.*
% Construct MetaData object from .txt file
MDObj2 = MetaData('File', 'mouseSampleData.txt', 'VarDescChar', '#');
% Retrieve the sample names
SNames = sampleNames(MDObj2)

См. также

| | |

Темы

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка