Импорт и управление данными
Функции
affyread | Считайте данные микромассива из файла Affymetrix GeneChip |
affysnpannotread | Чтение данных массива ДНК отображения Affymetrix из файла аннотации CSV-формата |
affyprobeseqread | Считайте файл данных, содержащий информацию о последовательности зондов для массива Affymetrix GeneChip |
celintensityread | Считайте интенсивность зонда из файлов Affymetrix CEL |
getgeodata | Извлечение данных формата Gene Expression Omnibus (GEO) |
geoseriesread | Чтение данных в формате Gene Expression Omnibus (GEO) Series (GSE) |
geosoftread | Чтение данных формата Gene Expression Omnibus (GEO) SOFT |
galread | Считайте данные микромассивов из файла списка массивов GenePix |
gprread | Считайте данные микромассивов из файла GenePix Results (GPR) |
agferead | Чтение файла редукции данных Agilent Software |
ilmnbsread | Считайте данные экспрессии генов, экспортированные из программного обеспечения Illumina BeadStudio |
imageneread | Считайте данные микромассивов из файла результатов ImaGene |
sptread | Считайте данные из файла SPOT |
goannotread | Чтение аннотаций из аннотированного файла Gene Ontology |
cytobandread | Чтение информации о цитогенетическом бандаже |
Классы
bioma.ExpressionSet | Содержат данные эксперимента по экспрессии генов микромассивов |
bioma.data.ExptData | Содержащие значения данных из эксперимента с микромассивами |
bioma.data.MetaData | Содержат метаданные из эксперимента с микромассивами |
bioma.data.MIAME | Содержащая информацию об эксперименте из эксперимента по экспрессии генов микромассивов |
Темы
Управление данными экспрессии генов в объектах
Обзор объектов для данных экспрессии генов микромассивов
Представление значений данных выражения в объектах DataMatrix
Создайте объекты DataMatrix, получите и установите свойства и получите доступ к данным.
Представление значений данных выражения в объектах ExptData
Создайте объекты ExptData, используйте свойства и методы и получайте доступ к данным.
Представление метаданных выборок и функций в объектах MetaData
Создайте объекты MetaData, используйте свойства и методы и получайте доступ к данным.
Представление информации об эксперименте в объекте MIAME
Создайте объекты MIAME, используйте свойства и методы и получайте доступ к данным.
Представление всех данных в объекте ExpressionSet
Создайте объекты ExpressionSet, используйте свойства и методы и получайте доступ к данным.
Обмен данными биоинформатики между Excel и MATLAB
Пример использования Spreadsheet Link™ с программным обеспечением для просмотра биоинформатических данных
Устройство хранения данных микромассивов
Bioinformatics Toolbox™ включает функции, объекты и методы для создания, хранения и доступа к данным микромассивов.
Доступ к онлайновым базам данных и репозиториям с помощью различных MATLAB® функций и импорта данных в рабочую область для последующих анализов.
