Класс: BioMap
Извлечение подписи (информация о выравнивании) из BioMap объект
Signature = getSignature(BioObj)
Signature = getSignature(BioObj, Subset)
Signature = getSignature(BioObj)Signature, массив ячеек из CIGAR-форматированных строк, каждая из которых представляет собой последовательность чтения в BioMap объект выравнивается по ссылочной последовательности.
Signature = getSignature(BioObj, Subset)Subset.
|
Объект |
|
Одно из следующих для задания подмножества элементов в
Примечание Если для задания используется массив ячеек с заголовками |
|
|
Создайте a BioMap и извлеките сигнатуры для различных элементов объекта:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the signature property of the second element in
% the object
Sig_2 = getSignature(BMObj1, 2)Sig_2 =
'35M'% Retrieve the signature properties of the first and third % elements in the object Sig_1_3 = getSignature(BMObj1, [1 3])
Sig_1_3 =
'36M'
'35M'% Retrieve the signature properties of all elements in the object Sig_All = getSignature(BMObj1);
Альтернатива использованию getSignature метод состоит в том, чтобы использовать индексацию через точку с Signature свойство:
BioObj.Sgnature(Indices)
В предыдущем синтаксисе Indices - вектор положительных целых чисел или логический вектор. Indices не может быть массивом ячеек из векторов символов или строковым вектором, содержащим заголовки последовательностей.