Переведите свойства объекта в синтаксис исходных опций
S = getCommand(optionsObject)S представляющие измененные свойства в optionsObject переведен в исходный синтаксис (префикс один или два штриха). По умолчанию функция преобразует только измененные свойства.
Примечание
Если вы задаете IncludeAll на trueпрограммное обеспечение преобразует все доступные свойства со значениями по умолчанию для неопределенных свойств. Единственным исключением является то, что когда значение по умолчанию свойства NaN, Inf, [], '', или "", тогда программное обеспечение не преобразует соответствующее свойство.
[1] Trapnell, C., B. Williams, G. Pertea, A. Mortazavi, G. Kwan, J. van Baren, S. Salzberg, B. Wold и L. Pachter. 2010. Сборка транскриптов и количественная оценка РНК-Seq выявляет неаннотированные транскрипты и переключение изоформ во время дифференцировки камер. Биотехнология природы. 28:511–515.
[2] Ли, Хэн и Ричард Дурбин. Быстрая и точная выравнивание при коротком считывании с преобразованием Burrows-Wheeler. Биоинформатика 25, № 14 (15 июля 2009): 1754-60. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp324.
[3] Ли, Хэн и Ричард Дурбин. Быстрая и точная выравнивание при долгом чтении с преобразованием Burrows-Wheeler. Биоинформатика 26, № 5 (1 марта 2010): 589-95. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp698.
BWAIndexOptions | CuffCompareOptions | CuffDiffOptions | CuffGFFReadOptions | CufflinksOptions | CuffMergeOptions | CuffNormOptions | CuffQuantOptions