exprprofrange
Вычислите область значений профилей экспрессии генов
Синтаксис
Range = exprprofrange(Data)
[Range, LogRange] = exprprofrange(Data)
... = exprprofrange(Data,
'ShowHist', ShowHistValue)
Аргументы
Data | Объект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену. |
ShowHistValue | Управляет отображением гистограммы с данными о области значений. По умолчанию это:
|
Описание
Range = exprprofrange(Data)Data, объект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену.
[ возвращает область значений журналов, то есть Range, LogRange] = exprprofrange(Data)log(max(prof))- log(min(prof)), каждого профиля выражения. Если вы не задаете выходные аргументы, exprprofrange отображает гистограмму столбиковой диаграммы области значений.
... = exprprofrange( управляет отображением гистограммы с данными о области значений. Варианты для Data,
'ShowHist', ShowHistValue)ShowHistValue являются true или false.
Примеры
Вычислите область значений профилей экспрессии генов
Загрузите данные микромассивов, содержащие уровни экспрессии генов Saccharomyces cerevisiae (дрожжи).
load yeastdataЭтот MAT-файл включает три переменные, которые добавляются в рабочую область MATLAB ®:
yeastvalues- матрица данных экспрессии геновгены - массив клеток с номерами доступа GenBank ® для маркировки строк в дрожжевых значениях
times - вектор значений времени для маркировки столбцов в дрожжевых значениях
Вычислите область значений профилей экспрессии для данных о дрожжах по мере изменения экспрессии генов во время метаболического сдвига от ферментации к дыханию. И отобразите гистограмму данных.
range = exprprofrange(yeastvalues,'ShowHist',true);