exprprofrange

Вычислите область значений профилей экспрессии генов

Синтаксис

Range = exprprofrange(Data)
[Range, LogRange] = exprprofrange(Data)
... = exprprofrange(Data, 'ShowHist', ShowHistValue)

Аргументы

Data Объект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену.
ShowHistValue

Управляет отображением гистограммы с данными о области значений. По умолчанию это:

  • false - Когда заданы выходные значения.

  • true - Когда выходные значения не заданы.

Описание

Range = exprprofrange(Data) вычисляет область значений каждого профиля выражения в Data, объект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену.

[Range, LogRange] = exprprofrange(Data) возвращает область значений журналов, то есть log(max(prof))- log(min(prof)), каждого профиля выражения. Если вы не задаете выходные аргументы, exprprofrange отображает гистограмму столбиковой диаграммы области значений.

... = exprprofrange(Data, 'ShowHist', ShowHistValue) управляет отображением гистограммы с данными о области значений. Варианты для ShowHistValue являются true или false.

Примеры

свернуть все

Загрузите данные микромассивов, содержащие уровни экспрессии генов Saccharomyces cerevisiae (дрожжи).

load yeastdata

Этот MAT-файл включает три переменные, которые добавляются в рабочую область MATLAB ®:

  • yeastvalues - матрица данных экспрессии генов

  • гены - массив клеток с номерами доступа GenBank ® для маркировки строк в дрожжевых значениях

  • times - вектор значений времени для маркировки столбцов в дрожжевых значениях

Вычислите область значений профилей экспрессии для данных о дрожжах по мере изменения экспрессии генов во время метаболического сдвига от ферментации к дыханию. И отобразите гистограмму данных.

range = exprprofrange(yeastvalues,'ShowHist',true);

Figure contains an axes. The axes with title Profile Ranges contains an object of type patch. This object represents absrange.

См. также

|

Представлено до R2006a