DataMatrix object

Структура данных, инкапсулирующая данные и метаданные из эксперимента с микромассивами, чтобы ее можно было индексировать по идентификаторам генов или зондов и по идентификаторам выборок

Описание

Объект DataMatrix является структурой данных, инкапсулирующей данные измерений и метаданные функций из эксперимента с микромассивами, так что он может индексироваться идентификаторами генов или зондов и идентификаторами выборок. Объект DataMatrix хранит экспериментальные данные в матрице с строками, обычно соответствующими именам генов или идентификаторам зондов, и столбцами, обычно соответствующими идентификаторам выборок. Объект DataMatrix также хранит метаданные, такие как имена генов или идентификаторы зондов и идентификаторы образцов, в именах строк и столбцов.

Вы создаете объект DataMatrix с помощью функции конструктора объектов DataMatrix.

Сводные данные свойств

Свойства объекта DataMatrix

Свойство	Описание
`Name`	Вектор символов, который описывает объект DataMatrix. По умолчанию это `''`.
`RowNames`	Пустой массив или массив ячеек из векторов символов, который задает имена для строк, обычно имена генов или идентификаторы зондов. Количество элементов в массиве ячеек должно равняться количеству строк в матрице. По умолчанию это пустой массив.
`ColNames`	Пустой массив или массив ячеек из векторов символов, который задает имена для столбцов, обычно для образцов идентификаторов. Количество элементов в массиве ячеек должно равняться количеству столбцов в матрице.
`NRows`	Только для чтения. Положительное число, которое определяет количество строк в матрице. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Вы можете получить к нему доступ, используя `get` способ.
`NCols`	Только для чтения. Положительное число, которое определяет количество столбцов в матрице. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Вы можете получить к нему доступ, используя `get` способ.
`NDims`	Только для чтения. Положительное число, которое задает количество размерностей в матрице. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Вы можете получить к нему доступ, используя `get` способ.
`ElementClass`	Только для чтения. Вектор символов, который задает тип класса элементов объекта DataMatrix, таких как `single` или `double`. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Вы можете получить к нему доступ, используя `get` способ.

Сводные данные по методам

Общие методы объекта DataMatrix

Метод	Описание
`colnames`	Извлечение или установка имен столбцов объекта DataMatrix.
`disp`	Отобразите объект DataMatrix.
`display`	Отобразите объект DataMatrix, распечатав имя объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, введите имя объекта DataMatrix в командной строке.
`dmwrite`	Запись объекта DataMatrix в текстовый файл.
`double`	Преобразуйте объект DataMatrix в массив двойной точности.
`get`	Получение информации об объекте DataMatrix.
`isempty`	Определите, пуст ли объект DataMatrix.
`isfinite`	Определите, являются ли элементы объекта DataMatrix конечными.
`isinf`	Определите, являются ли элементы объекта DataMatrix бесконечными.
`isnan`	Определите, являются ли элементы объекта DataMatrix NaN.
`isscalar`	Определите, является ли объект DataMatrix скалярным.
`isequal`	Проверьте объекты DataMatrix на равенство.
`isequaln`	Протестируйте объекты DataMatrix на равенство, рассматривая NaNs как равные.
`isvector`	Определите, является ли объект DataMatrix вектором.
`length`	Возвращает длину объекта DataMatrix.
`ndims`	Возвращает количество размерностей в объекте DataMatrix.
`numel`	Возвращает количество элементов в объекте DataMatrix.
`plot`	Нарисуйте 2D график объекта DataMatrix.
`rownames`	Извлечение или установка имен строк объекта DataMatrix.
`set`	Установите свойство объекта DataMatrix.
`single`	Преобразуйте объект DataMatrix в массив с одной точностью.
`size`	Возвращает размер объекта DataMatrix.

Методы манипулирования данными в объекте DataMatrix

Метод	Описание
`cat`	Конкатенация объектов DataMatrix. `horzcat` и `vertcat` методы реализуют специальные случаи.
`horzcat`	Конкатенация объектов DataMatrix по горизонтали.
`sortcols`	Сортировка столбцов объекта DataMatrix в порядке возрастания или убывания.
`sortrows`	Сортировка строк объекта DataMatrix в порядке возрастания или убывания.
`subsasgn`	Подписанное назначение для объекта DataMatrix. Чтобы обратиться к этому методу, используйте круглые скобки или индексацию точек, описанную в разделе Доступ к данным в объектах DataMatrix.
`subsref`	Подписанная ссылка для объекта DataMatrix. Чтобы обратиться к этому методу, используйте круглые скобки или индексацию точек, описанную в разделе Доступ к данным в объектах DataMatrix.
`transpose`	Транспонируйте объект DataMatrix.
`vertcat`	Конкатенация объектов DataMatrix по вертикали.

Описательная статистика и статистические методы обучения

Метод	Описание
`kmeans`	K-образная кластеризация.
`max`	Возвращает максимальные значения в объекте DataMatrix.
`mean`	Возвращает средние или средние значения в объекте DataMatrix.
`median`	Возвращает медианные значения в объекте DataMatrix.
`min`	Возвращает минимальные значения в объекте DataMatrix.
`nanmax`	Возвращает максимальное значение в объекте DataMatrix, игнорируя значения NaN.
`nanmean`	Возвращает средние или средние значения в объекте DataMatrix, игнорируя значения NaN.
`nanmedian`	Возвращает медианные значения в объекте DataMatrix, игнорируя значения NaN.
`nanmin`	Возвращает минимальные значения в объекте DataMatrix, игнорируя значения NaN.
`nanstd`	Возвращает стандартные значения отклонения в объекте DataMatrix, игнорируя значения NaN.
`nansum`	Возвращает сумму элементов объекта DataMatrix, игнорирующих значения NaN.
`nanvar`	Возвращает значения отклонения в объекте DataMatrix, игнорируя значения NaN.
`pca`	Анализ основных компонентов на данных.
`pdist`	Парное расстояние.
`std`	Возвращает стандартные значения отклонения в объекте DataMatrix.
`sum`	Возвращает сумму элементов в объекте DataMatrix.
`var`	Возвращает значения отклонения в объекте DataMatrix.

Унарные методы - экспоненциальные

Метод	Описание
`exp`	Экспоненциальный.
`log`	Естественный логарифм.
`log10`	Общий (база 10) логарифм.
`log2`	Основание 2 логарифмирует и рассекает числа с плавающей запятой на экспоненты и мантиссы.
`pow2`	Базовая 2 степень и шкала чисел с плавающей запятой.
`sqrt`	Квадратный корень.

Унарные методы - целое число

Метод	Описание
`ceil`	Объект Round DataMatrix к бесконечности.
`fix`	Объект Round DataMatrix к нулю.
`floor`	Объект Round DataMatrix к минус бесконечности.
`round`	Объект Round DataMatrix до ближайшее целого числа.

Унарные методы - пользовательские

Метод	Описание
`dmarrayfun`	Применить функцию к каждому элементу объекта DataMatrix.

Двоичные методы - арифметический оператор

Оператор	Метод	Описание
`+`	`plus`	Добавление объектов DataMatrix
`-`	`minus`	Вычесть объекты DataMatrix.
`.*`	`times`	Умножайте объекты DataMatrix.
`./`	`rdivide`	Правый массив разделяет объекты DataMatrix.
`.\`	`ldivide`	Левый массив разделяет объекты DataMatrix.
`.^`	`power`	Объекты DataMatrix степени массива.

Двоичные методы - реляционный оператор

Оператор	Метод	Описание
`<`	`lt`	Протестируйте объекты DataMatrix на менее чем.
`<=`	`le`	Протестируйте объекты DataMatrix на меньше или равно.
`>`	`gt`	Протестируйте объекты DataMatrix на больше.
`>=`	`ge`	Протестируйте объекты DataMatrix на больше или равно.
`==`	`eq`	Проверьте объекты DataMatrix на равенство.
`~=`	`ne`	Проверяйте объекты DataMatrix на неравенство.

Двоичные методы - пользовательские

Метод	Описание
`dmbsxfun`	Примените двоичную операцию «элемент за элементом» к двум объектам DataMatrix с включенным расширением синглтона.

Примеры

Пример 5. Определение свойств и значений свойств объекта DataMatrix

Можно отобразить все свойства и их текущие значения объекта DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

get(DMobj)

Можно вернуть все свойства и их текущие значения DMobj, объект DataMatrix, для DMstructскалярная структура, в которой каждое имя поля является свойством объекта DataMatrix, и каждое поле содержит значение этого свойства с помощью следующего синтаксиса:

DMstruct = get(DMobj)

Можно вернуть значение определенного свойства объекта DataMatrix, DMobj, при использовании любого из следующих синтаксисов:

PropertyValue = get(DMObj, 'PropertyName')

PropertyValue = DMObj.PropertyName

Можно вернуть значение определенных свойств объекта DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

[Property1Value, Property2Value, ...] = get(DMobj, ...
'Property1Name', 'Property2Name', ...)

Пример 6. Определение возможных значений свойств объекта DataMatrix

Можно отобразить возможные значения для всех свойств, которые имеют фиксированный набор значений свойств в объекте DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

set(DMobj)

Можно отобразить возможные значения для определенного свойства, которое имеет фиксированный набор значений свойств в объекте DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

set(DMObj,  'PropertyName')

Пример 7. Определение свойств объекта DataMatrix

Можно задать определенное свойство объекта DataMatrix, DMObj, при использовании любого из следующих синтаксисов:

DMObj = set(DMObj,  'PropertyName', PropertyValue)

DMObj.PropertyName = PropertyValue

Можно задать несколько свойств объекта DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

set(DMobj,  'PropertyName1', PropertyValue1, ...
    'PropertyName2', PropertyValue2, ...)

Примечание

Для получения дополнительных примеров создания и использования объектов DataMatrix, смотрите Представление значений данных выражения в объектах DataMatrix.

Вопросы совместимости

расширить все

`princomp` метод был переименован

Ошибки, начинающиеся в R2017b

The princomp метод DataMatrix object был переименован. Замените образцы princomp с pca.

См. также

Введенный в R2008b

Документация

DataMatrix object

Описание

Сводные данные свойств

Сводные данные по методам

Примеры

Вопросы совместимости

`princomp` метод был переименован

См. также

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Документация

DataMatrix object

Описание

Сводные данные свойств

Сводные данные по методам

Примеры

Вопросы совместимости

princomp метод был переименован

См. также

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка

`princomp` метод был переименован