exprprofvar
Вычислите отклонение профилей экспрессии генов
Синтаксис
Variance = exprprofvar(Data)
exprprofvar(..., 'PropertyName', PropertyValue,...)
exprprofvar(..., 'ShowHist', ShowHistValue)
Аргументы
Data | Объект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену. |
| Управляет отображением гистограммы с данными о отклонении. По умолчанию это:
|
Описание
Variance = exprprofvar(Data)Data, объект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену. Если вы не задаете выходные аргументы, эта функция отображает гистограммный штриховой график области значений.
exprprofvar(..., ' задает необязательные свойства, используя имя свойства/ значение пары.PropertyName', PropertyValue,...)
exprprofvar(..., 'ShowHist', управляет отображением гистограммы с данными о области значений. Варианты для ShowHistValue)ShowHistValue являются true или false.
Примеры
Вычислите отклонение профилей экспрессии генов
Загрузите данные микромассивов, содержащие уровни экспрессии генов Saccharomyces cerevisiae (дрожжи).
load yeastdataЭтот MAT-файл включает три переменные, которые добавляются в рабочую область MATLAB ®:
yeastvalues- матрица данных экспрессии геновгены - массив клеток с номерами доступа GenBank ® для маркировки строк в дрожжевых значениях
times - вектор значений времени для маркировки столбцов в дрожжевых значениях
Вычислите отклонение профилей экспрессии для данных о дрожжах по мере изменения экспрессии генов во время метаболического сдвига от ферментации к дыханию. И отобразите гистограмму данных.
range = exprprofvar(yeastvalues,'ShowHist',true);