Сегментация образца с использованием Mask R-CNN Глубокое обучение

В этом примере показано, как сегментировать отдельные образцы людей и автомобилей с помощью многоклассовой сверточной нейронной сети на основе региона Маска (R-CNN).

Сегментация образца является методом компьютерного зрения, в котором вы обнаруживаете и локализуете объекты с одновременной генерацией карты сегментации для каждого из обнаруженных образцов.

Этот пример сначала показывает, как выполнить сегментацию образца с помощью предварительно обученной Mask R-CNN, которая обнаруживает два класса. Затем можно опционально загрузить набор данных и обучить мультикласс Mask R-CNN.

Выполните сегментацию образца с помощью предварительно обученной маски R-CNN

Загрузите предварительно обученную Mask R-CNN.

dataFolder = fullfile(tempdir,"coco");
trainedMaskRCNN_url = 'https://www.mathworks.com/supportfiles/vision/data/maskrcnn_pretrained_person_car.mat';
helper.downloadTrainedMaskRCNN(trainedMaskRCNN_url,dataFolder);
pretrained = load(fullfile(dataFolder,'maskrcnn_pretrained_person_car.mat'));
net = pretrained.net;

Извлечь подсеть сегментации маски можно используя extractMaskNetwork вспомогательная функция, которая присоединена к этому примеру как вспомогательный файл в папке helper.

maskSubnet = helper.extractMaskNetwork(net);

Сеть обучена обнаруживать людей и автомобили. Задайте имена классов, включая 'background' класс, а также количество классов, исключая 'background' класс.

classNames = {'person','car','background'};
numClasses = length(classNames)-1;

Чтение тестового изображения, содержащего объекты целевых классов.

imTest = imread('visionteam.jpg');

Определите целевой размер изображения для вывода.

targetSizeTest = [700 700 3];

Измените размер изображения, сохраняя соотношение сторон и масштабируя наибольшую размерность до целевого размера.

if size(imTest,1) > size(imTest,2)
   imTest = imresize(imTest,[targetSizeTest(1) NaN]); 
else
   imTest = imresize(imTest,[NaN targetSizeTest(2)]);     
end

Задайте параметры конфигурации сети, используя createMaskRCNNConfig вспомогательная функция, которая присоединена к этому примеру как вспомогательный файл.

imageSizeTrain = [800 800 3];
params = createMaskRCNNConfig(imageSizeTrain,numClasses,classNames);

Обнаружите объекты и их маски с помощью функции helper detectMaskRCNN, который присоединен к этому примеру как вспомогательный файл.

[boxes,scores,labels,masks] = detectMaskRCNN(net,maskSubnet,imTest,params);

Визуализируйте предсказания путем наложения обнаруженных масок на изображение с помощью insertObjectMask функция.

if(isempty(masks))
    overlayedImage = imTest;
else
    overlayedImage = insertObjectMask(imTest,masks);
end
imshow(overlayedImage)

Отображение ограничивающих рамок и меток на объектах.

showShape("rectangle",gather(boxes),"Label",labels,"LineColor",'r')

Загрузка обучающих данных

Набор данных обучающих изображений COCO 2014 [2] состоит из 82 783 изображений. Данные аннотаций содержат по меньшей мере пять подписей, соответствующих каждому изображению.

Создайте директории для хранения обучающих изображений COCO и данных аннотации.

imageFolder = fullfile(dataFolder,"images");
captionsFolder = fullfile(dataFolder,"annotations");
if ~exist(imageFolder,'dir')
    mkdir(imageFolder)
    mkdir(captionsFolder)
end

Загрузите обучающие изображения и подписи COCO 2014 из https://cocodataset.org/#download, нажав на ссылки «2014 Train image» и «2014 Train/Val annotations» соответственно. Извлеките файлы изображений в папку, заданную imageFolder. Извлеките файлы аннотации в папку, заданную captionsFolder.

annotationFile = fullfile(captionsFolder,"instances_train2014.json");
str = fileread(annotationFile);

Чтение и предварительная обработка обучающих данных

Чтобы обучить Mask R-CNN, вам нужны эти данные.

  • Изображения RGB, которые служат входом в сеть, заданные как H-by-W-by-3 числовые массивы.

  • Ограничительные рамки для объектов в изображениях RGB, заданные как NumObjects-by-4 матрицы, с строками в формате [x y w h]).

  • Метки образцов, заданные как NumObjects-by-1 строковые векторы.

  • Образцы. Каждая маска является сегментацией одного образца в изображении. Набор данных COCO задает образцы объекта с помощью координат многоугольников, форматированных как NumObjects-by-2 массивов ячеек. Каждая строка массива содержит (x, y) координаты многоугольника вдоль контура одного образца на изображении. Однако Mask R-CNN в этом примере требует двоичных масок, заданных как логические массивы размера H-на-W-на-NumObjects.

Формат данных аннотации COCO как файлов MAT

COCO API для MATLAB позволяет вам получить доступ к данным аннотации. Загрузите COCO API для MATLAB из https://github.com/cocodataset/cocoapi, нажав кнопку « Код» и выбрав «Загрузить ZIP». Извлечение cocoapi-master директория и его содержимое в папку, заданную dataFolder. Если это необходимо для вашей операционной системы, скомпилируйте gason parser, следуя инструкциям в gason.m файл в MatlabAPI подкаталог.

Укажите расположение директории для COCO API для MATLAB и добавьте директорию к пути.

cocoAPIDir = fullfile(dataFolder,"cocoapi-master","MatlabAPI");
addpath(cocoAPIDir);

Укажите папку, в которой будут храниться файлы MAT.

unpackAnnotationDir = fullfile(dataFolder,"annotations_unpacked","matFiles");
if ~exist(unpackAnnotationDir,'dir')
    mkdir(unpackAnnotationDir)
end

Извлеките аннотации COCO в файлы MAT с помощью unpackAnnotations вспомогательная функция, которая присоединена к этому примеру как вспомогательный файл в папке helper. Каждый файл MAT соответствует одному обучающему изображению и содержит имя файла, ограничивающие рамки, метки образцов и маски образцов для каждого обучающего изображения. Функция преобразует образцы объектов, заданные как многоугольники, в двоичные маски с помощью poly2mask функция.

trainClassNames = {'person','car'};
helper.unpackAnnotations(trainClassNames,annotationFile,imageFolder,unpackAnnotationDir);

Создайте Datastore

Mask R-CNN ожидает входные данные как массив ячеек 1 на 4, содержащий обучающее изображение RGB, ограничительные рамки, метки образцов и маски образцов.

Создайте файловый datastore с пользовательской функцией чтения, c ocoAnnotationMATReader, который считывает содержимое распакованных файлов MAT аннотации, преобразует обучающие изображения полутонового цвета в RGB и возвращает данные как массив ячеек 1 на 4 в необходимом формате. Пользовательская функция чтения присоединена к этому примеру как вспомогательный файл в папке helper.

ds = fileDatastore(unpackAnnotationDir, ...
    'ReadFcn',@(x)helper.cocoAnnotationMATReader(x,imageFolder));

Задайте размер входа сети.

imageSize = [800 800 3];

Предварительно обработайте обучающие изображения, ограничительные рамки и маски образцов до размера, ожидаемого сетью с помощью transform функция. The transform функция обрабатывает данные с помощью операций, заданных в preprocessData вспомогательная функция. Функция helper присоединена к примеру как вспомогательный файл в папке helper.

The preprocessData Функция helper выполняет эти операции с обучающими изображениями, ограничивающими рамками и масками образцов:

  • Измените размер изображений и масок RGB с помощью imresize выполнять функцию и перерассчитывать ограничительные рамки с помощью bboxresize функция. Функция helper выбирает однородный масштабный коэффициент, так что меньшая размерность изображения, ограничивающего прямоугольника или маски равен размеру входа целевой сети.

  • Обрезка изображений и масок RGB с помощью imcrop функции и обрезка ограничивающих рамок с помощью bboxcrop функция. Функция helper обрабатывает изображение, ограничивающий прямоугольник или маску так, что больший размерность равен целевому размеру входа сети.

  • Масштабируйте пиксельные значения изображений RGB в области значений [0, 1].

dsTrain = transform(ds,@(x)helper.preprocessData(x,imageSize));

Предварительный просмотр данных, возвращенных преобразованным datastore.

data = preview(dsTrain)
data=1×4 cell array
    {800×800×3 uint8}    {16×4 double}    {16×1 categorical}    {800×800×16 logical}

Создайте маску R-CNN Слоев сети

Mask R-CNN основывается на Faster R-CNN с ResNet-101 базовой сетью. Получите слои Faster R-CNN с помощью fasterRCNNLayers функция.

netFasterRCNN = fasterRCNNLayers(params.ImageSize,numClasses,params.AnchorBoxes,'resnet101');

Измените сеть для Mask R-CNN с помощью createMaskRCNN вспомогательная функция. Эта функция присоединена к примеру как вспомогательный файл. Функция helper выполняет следующие модификации сети:

  1. Замените rpnSoftmaxLayer с пользовательским слоем программного обеспечения RPM, заданным вспомогательным файлом RPNSoftmax в папке layer.

  2. Замените regionProposalLayer со слоем предложения пользовательской области, заданным вспомогательным файлом RegionProposal в папке layer.

  3. Замените roiMaxPooling2dLayer с roiAlignLayer.

  4. Добавьте заголовок сегментации маски для сегментации на уровне пикселей.

netMaskRCNN = createMaskRCNN(netFasterRCNN,numClasses,params);

Преобразуйте сеть в dlnetwork (Deep Learning Toolbox) объект.

dlnet = dlnetwork(netMaskRCNN);

Визуализация сети с помощью Deep Network Designer.

deepNetworkDesigner(netMaskRCNN)

Настройка опций обучения

Задайте опции для оптимизации SGDM. Обучите сеть на 30 эпох.

initialLearnRate = 0.01;
momentum = 0.9;
decay = 0.0001;
velocity = [];
maxEpochs = 30;
miniBatchSize = 2;

Пакетные обучающие данные

Создайте minibatchqueue (Deep Learning Toolbox) объект, который управляет мини-пакетированием наблюдений в пользовательском цикле обучения. The minibatchqueue объект также переводит данные в dlarray (Deep Learning Toolbox) объект, который включает автоматическую дифференциацию в применениях глубокого обучения.

Задайте пользовательскую функцию дозирования с именем miniBatchFcn. Изображения сгруппированы по четвертой размерности, чтобы получить сформированный пакет H-на-W-на-C-на-miniBatchSize. Для других достоверных данных сконфигурирован массив ячеек длиной, равной размеру мини-пакета.

miniBatchFcn = @(img,boxes,labels,masks) deal(cat(4,img{:}),boxes,labels,masks);

Задайте мини-пакетный формат извлечения данных для данных изображения как "SSCB" (пространственный, пространственный, канальный, пакетный). Если поддерживаемый графический процессор доступен для расчетов, то minibatchqueue объект обрабатывает мини-пакеты в фоновом режиме в параллельном пуле во время обучения.

mbqTrain = minibatchqueue(dsTrain,4, ...
    "MiniBatchFormat",["SSCB","","",""], ...
    "MiniBatchSize",miniBatchSize, ...
    "OutputCast",["single","","",""], ...
    "OutputAsDlArray",[true,false,false,false], ...
    "MiniBatchFcn",miniBatchFcn, ...
    "OutputEnvironment",["auto","cpu","cpu","cpu"]);

Обучите сеть

Чтобы обучить сеть, установите doTraining переменная в следующем коде, для true. Обучите модель в пользовательском цикле обучения. Для каждой итерации:

  • Считайте данные для текущего мини-пакета с помощью next (Deep Learning Toolbox) функция.

  • Оцените градиенты модели с помощью dlfeval (Deep Learning Toolbox) функцию и networkGradients вспомогательная функция. Функция networkGradients, перечисленная как вспомогательная функция, возвращает градиенты потерь относительно настраиваемых параметров, соответствующих потерь мини-пакета и состояния текущей партии.

  • Обновляйте параметры сети с помощью sgdmupdate (Deep Learning Toolbox) функция.

  • Обновление state параметры сети с скользящим средним значением.

  • Обновите график процесса обучения.

Обучите на графическом процессоре, если он доступен. Для использования GPU требуется Parallel Computing Toolbox™ и графический процессор с поддержкой CUDA ® NVIDIA ®. Для получения дополнительной информации смотрите Поддержку GPU by Release (Parallel Computing Toolbox).

doTraining = false;
if doTraining
    
    iteration = 1; 
    start = tic;
    
     % Create subplots for the learning rate and mini-batch loss
    fig = figure;
    [lossPlotter] = helper.configureTrainingProgressPlotter(fig);
    
    % Initialize verbose output
    helper.initializeVerboseOutput([]);
    
    % Custom training loop
    for epoch = 1:maxEpochs
        reset(mbqTrain)
        shuffle(mbqTrain)
    
        while hasdata(mbqTrain)
            % Get next batch from minibatchqueue
            [X,gtBox,gtClass,gtMask] = next(mbqTrain);
        
            % Evaluate the model gradients and loss
            [gradients,loss,state] = dlfeval(@networkGradients,X,gtBox,gtClass,gtMask,dlnet,params);
            dlnet.State = state;
            
            % Compute the learning rate for the current iteration
            learnRate = initialLearnRate/(1 + decay*iteration);
            
            if(~isempty(gradients) && ~isempty(loss))    
                [dlnet.Learnables,velocity] = sgdmupdate(dlnet.Learnables,gradients,velocity,learnRate,momentum);
            else
                continue;
            end
            
            helper.displayVerboseOutputEveryEpoch(start,learnRate,epoch,iteration,loss);
                
            % Plot loss/accuracy metric
            D = duration(0,0,toc(start),'Format','hh:mm:ss');
            addpoints(lossPlotter,iteration,double(gather(extractdata(loss))))
            subplot(2,1,2)
            title(strcat("Epoch: ",num2str(epoch),", Elapsed: "+string(D)))
            drawnow
            
            iteration = iteration + 1;    
        end
    
    end
    net = dlnet;
    
    % Save the trained network
    modelDateTime = string(datetime('now','Format',"yyyy-MM-dd-HH-mm-ss"));
    save(strcat("trainedMaskRCNN-",modelDateTime,"-Epoch-",num2str(maxEpochs),".mat"),'net');
    
end

Используя обученную сеть, можно выполнить сегментацию образцов на тестовых изображениях, как показано в разделе Выполните сегментацию образцов Используя предварительно обученную маску R-CNN.

Ссылки

[1] Он, Кайминг, Джорджия Гкиоксари, Пётр Доллар и Росс Гиршик. «Маска R-CNN». Препринт, представленный 24 января 2018 года. https://arxiv.org/abs/1703.06870.

[2] Лин, Цунг-И, Майкл Мэйр, Серж Рэйни, Любомир Бурдев, Росс Гиршик, Джеймс Хейс, Пьетро Перона, Дева Раманан, К. Лоуренс Зитник и Пётр Доллар. «Microsoft COCO: общие объекты в контексте», 1 мая 2014 года. https://arxiv.org/abs/1405.0312v3.

См. также

Функции

Объекты

Похожие темы

Внешние веб-сайты

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте