Объект, содержащий информацию о реакции модели
Объект реакции представляет реакцию, которая описывает преобразование, транспорт или процесс привязки, который изменяет одну или несколько разновидностей. Как правило, изменение является суммой разновидности. Например:
Creatine + ATP <-> ADP + phosphocreatine
glucose + 2 ADP + 2 Pi -> 2 lactic acid + 2 ATP + 2 H2O
Пробелы требуются до и после имен разновидностей и стехиометрических значений.
См. Сводные данные Свойства для ссылок на страницы с описанием свойства объекта реакции.
Свойства задают характеристики объекта. Используйте get и set команды к свойствам объекта списка и изменению их значения в командной строке. Можно графически изменить свойства объектов в графическом интерфейсе пользователя.
Примечание
Если вы создаете новую реакцию в командной строке и не задаете ее имя, реакция получает автоматическое имя Reaction_N, где N является положительным целым числом. N увеличивается монотонно, когда вы добавляете больше реакций.
Если вы копируете использование реакции copyobj, имя скопированной реакции сгенерировано путем добавления _N, где N является самым маленьким целым числом не в использовании тем префиксом. Например, GivenName_1 копируется в GivenName_1_1.
| addreaction (модель) | Создайте реакцию, возражают и добавляют к объекту модели |
| addkineticlaw (реакция) | Создайте кинетический закон, возражают и добавляют к объекту реакции |
| addproduct (реакция) | Добавьте объект разновидностей продукта в объект реакции |
| addreactant (реакция) | Добавьте объект разновидностей как реагент к объекту реакции |
| copyobj | Скопируйте объект SimBiology и его дочерние элементы |
| delete | Объект Delete SimBiology |
| display | Отобразите сводные данные объекта SimBiology |
| get | Получите свойства объектов SimBiology |
| getadjacencymatrix (модель) | Получите матрицу смежности от объекта модели |
| getstoichmatrix (модель) | Получите матрицу стехиометрии от объекта модели |
| rename | Переименуйте выражения обновления и объект |
| rmproduct (реакция) | Удалите объект разновидностей из продуктов объекта реакции |
| rmreactant (реакция) | Удалите объект разновидностей из реагентов объекта реакции |
| set | Установите свойства объектов SimBiology |
| Active | Укажите на объект в использовании в процессе моделирования |
| KineticLaw | Покажите кинетический закон, используемый для ReactionRate |
| Name | Задайте имя объекта |
| Notes | Текст HTML, описывающий объект SimBiology |
| Parent | Укажите на родительский объект |
| Products | Массив продуктов реакции |
| Reactants | Массив реагентов реакции |
| Reaction | Реакция объекта Reaction |
| ReactionRate | Уравнение скорости реакции в объекте реакции |
| Reversible | Задайте, обратима ли реакция или необратима |
| Stoichiometry | Коэффициенты разновидностей в реакции |
| Tag | Задайте метку для объекта SimBiology |
| Type | Отобразите тип объекта SimBiology |
| UserData | Задайте данные, чтобы сопоставить с объектом |
Определения и оценки реакций в моделях SimBiology, AbstractKineticLaw object, Configset object, KineticLaw object, Model object, Parameter
object, Root object, Rule object, Species
object
