AbstractKineticLaw object | Кинетическая информация о законе в библиотеке |
accelerate | Подготовьте экспортируемую модель SimBiology к ускорению |
accelerate(SimFunction) | Подготовьте объект SimFunction к ускоренным симуляциям |
add | Добавьте значения количества, дозы или варианты к SimBiology. Объект Scenarios |
addcompartment | Создайте объект отсека |
addCompartment | Добавьте отсек в объект PKModelDesign |
addconfigset | Создайте конфигурацию модели, возражают и добавляют к объекту модели |
addcontent (variant) | Добавьте содержимое к различному объекту |
adddose | Добавьте объект дозы смоделировать |
addevent | Добавьте объект-событие в объект модели |
addkineticlaw (reaction) | Создайте кинетический закон, возражают и добавляют к объекту реакции |
addparameter | Создайте объект параметра и добавьте к или кинетическому объекту закона модели |
addproduct (reaction) | Добавьте объект разновидностей продукта в объект реакции |
addreactant (reaction) | Добавьте объект разновидностей как реагент к объекту реакции |
addreaction | Создайте реакцию, возражают и добавляют к объекту модели |
addrule | Создайте правило, возражают и добавляют к объекту модели |
addspecies | Создайте разновидности, возражают и добавляют к объекту отсека в объекте модели |
addvariant | Добавьте вариант в модель |
boxplot(LeastSquaresResults,OptimResults,NLINResults) | Создайте диаграмму, показывающую изменение предполагаемых параметров модели SimBiology |
boxplot(NLMEResults) | Создайте диаграмму, показывающую изменение предполагаемых параметров модели SimBiology |
ci2table | Возвратите сводную таблицу результатов доверительного интервала |
commit (variant) | Передайте различное содержимое модели |
Compartment object | Опции для отсеков |
CompileOptions | Размерный анализ и модульные опции преобразования |
ConfidenceInterval | Объект, содержащий результаты доверительного интервала |
Configset object | Информация о настройках решателя для симуляции модели |
construct | Создайте модель SimBiology из объекта PKModelDesign |
constructDefaultFixedEffectValues (covmodel) | Создайте вектор первоначальной оценки, необходимый для подгонки |
copyobj (any object) | Скопируйте объект SimBiology и его дочерние элементы |
CovariateModel object | Задайте отношение между параметрами и ковариантами |
covariateModel(NLMEResults) | Возвратите копию ковариационной модели, которая использовалась в нелинейной оценке смешанных эффектов с помощью sbiofitmixed |
createDoses | Создайте объекты дозы из объекта groupedData |
createSimFunction | Объект Create SimFunction |
delete (any object) | Объект Delete SimBiology |
display (any object) | Отобразите сводные данные объекта SimBiology |
EstimatedInfo object | Объект, содержащий информацию о предполагаемых количествах модели |
Event object | Сохраните информацию о событии |
export | Экспортируйте модели SimBiology для развертывания и автономные приложения |
findUnusedComponents | Найдите неиспользованные разновидности, параметры и отсеки в модели |
findUsages(AbstractKineticLaw) | Узнайте, как используется объект AbstractKineticLaw |
findUsages(species,parameter,compartment) | Узнайте, как разновидность, параметр или отсек используются в модели |
findUsages(unit,unitprefix) | Узнайте, как модульный или модульный префикс используется |
fitted(LeastSquaresResults,OptimResults,NLINResults) | Возвратите результаты симуляции модели SimBiology, подбиравшей с помощью регрессии наименьших квадратов |
fitted(NLMEResults) | Возвратите результаты симуляции подбиравшей нелинейной модели смешанных эффектов |
get (any object) | Получите свойства объектов |
getadjacencymatrix (model) | Получите матрицу смежности от объекта модели |
getconfigset | Получите объект конфигурации модели от объекта модели |
getCovariateData (pkdata) | Создайте матрицу проекта, необходимую для подгонки |
getdata (SimData) | Получите данные из объектного массива SimData |
getdose (model) | Возвратите объект дозы SimBiology |
getEntry | Получите содержимое записи от SimBiology. Объект Scenarios |
getparameters (kineticlaw) | Получите определенные параметры в кинетическом объекте закона |
getsensmatrix (SimData) | Получите 3-D матрицу чувствительности от массива SimData |
getspecies (kineticlaw) | Получите определенные разновидности в кинетическом объекте закона |
getstoichmatrix (model) | Получите матрицу стехиометрии от объекта модели |
getTable(ScheduleDose,RepeatDose) | Возвратите данные из объекта дозы SimBiology как таблица |
getvariant (model) | Станьте различными от модели |
groupedData | Подобный таблице набор данных и метаданных |
groupedData2table | Преобразуйте объект groupedData представить в виде таблицы |
isaccelerated(SimFunction) | Определите, ускоряется ли объект SimFunction |
KineticLaw object | Кинетическая информация о законе для реакции |
LeastSquaresResults object | Объект результатов, содержащий оценку, следует из регрессии наименьших квадратов |
load | Загрузите переменные из файла в рабочую область |
Model object | Информация компонента и модели |
Model.getequations | Возвратите систему уравнений для объекта модели |
NLINResults object | Оценка заканчивается объект, подкласс LeastSquaresResults |
NLMEResults object | Объект результатов, содержащий оценку, следует из нелинейного моделирования смешанных эффектов |
OptimResults object | Оценка заканчивается объект, подкласс LeastSquaresResults |
Parameter object | Параметр и информация об осциллографе |
ParameterConfidenceInterval | Объект, содержащий доверительный интервал, заканчивается для предполагаемых параметров |
PKCompartment object | Используемый PKModelDesign, чтобы создать модель SimBiology |
PKModelDesign object | Объект Helper создать фармакокинетическую модель |
PKModelMap object | Задайте роли компонентов модели SimBiology |
plot | Постройте результаты доверительного интервала параметра |
plot | Постройте результаты доверительного интервала для прогнозов модели |
plot(LeastSquaresResults,OptimResults,NLINResults) | Сравните результаты симуляции с обучающими данными, создав подграфик курса времени для каждой группы |
plot(NLMEResults) | Сравните результаты симуляции с обучающими данными, создав подграфик курса времени для каждой группы |
plotActualVersusPredicted(LeastSquaresResults,OptimResults,NLINResults) | Сравните прогнозы с фактическими данными, создав подграфик для каждого ответа |
plotActualVersusPredicted(NLMEResults) | Сравните прогнозы с фактическими данными, создав подграфик для каждого ответа |
plotResidualDistribution(LeastSquaresResults,OptimResults,NLINResults) | Постройте распределение остаточных значений |
plotResidualDistribution(NLMEResults) | Постройте распределение остаточных значений |
plotResiduals(LeastSquaresResults,OptimResults,NLINResults) | Постройте остаточные значения для каждого ответа, с помощью времени, группы или прогноза как ось X |
plotResiduals(NLMEResults) | Постройте остаточные значения для каждого ответа, с помощью времени, группы или прогноза как ось X |
predict(LeastSquaresResults,OptimResults,NLINResults) | Симулируйте и оцените подбиравшую модель SimBiology |
predict(NLMEResults) | Симулируйте и оцените подбиравшую модель SimBiology |
PredictionConfidenceInterval | Объект, содержащий доверительный интервал, заканчивается для прогнозов модели |
random(LeastSquaresResults,OptimResults,NLINResults) | Симулируйте модель SimBiology, добавив изменения путем выборки ошибочной модели |
random(NLMEResults) | Симулируйте модель SimBiology, добавив изменения путем выборки ошибочной модели |
Reaction object | Опции для реакций модели |
removeconfigset (model) | Удалите конфигурацию модели из модели |
removedose (model) | Добавьте объект дозы смоделировать |
removevariant (model) | Удалите вариант из модели |
rename (compartment, parameter, species, reaction) | Переименуйте выражения обновления и объект |
reorder (model, compartment, kinetic law) | Переупорядочьте списки компонента |
RepeatDose object | Задайте протокол дозирования препарата |
resample (SimData) | Передискретизируйте объектный массив SimData на новый временной вектор |
reset (root) | Удалите все объекты модели из корневого объекта |
rmcontent (variant) | Удалите содержимое из различного объекта |
rmproduct (reaction) | Удалите объект разновидностей из продуктов объекта реакции |
rmreactant (reaction) | Удалите объект разновидностей из реагентов объекта реакции |
Root object | Содержите модели, модульные библиотеки и абстрактные кинетические юридические библиотеки |
Rule object | Содержите правило для разновидностей и параметров |
RuntimeOptions | Опции для регистрируемых разновидностей |
sbioabstractkineticlaw | Создайте кинетическое определение закона |
sbioaccelerate | Подготовьте объект модели к ускоренным симуляциям |
sbioaddtolibrary | Добавьте к пользовательской библиотеке |
sbioconsmoiety | Найдите сохраненные половины в модели SimBiology |
sbioconvertunits | Преобразуйте стоимость единицы и стоимость единицы к новому модулю |
sbiocopylibrary | Скопируйте библиотеку в диск |
sbiodesktop | Откройте рабочий стол SimBiology для моделирования и симуляции |
sbiodose | Создайте объект дозы |
sbioensembleplot | Покажите результаты запуска ансамбля с помощью 2D или 3-D графиков |
sbioensemblerun | Несколько стохастических запусков ансамбля модели SimBiology |
sbioensemblestats | Получите статистику от данных о запуске ансамбля |
sbiofit | Выполните регрессию нелинейного метода наименьших квадратов |
sbiofitmixed | Подбирайте нелинейную модель смешанных эффектов (требует программного обеспечения Statistics and Machine Learning Toolbox), |
sbiofitstatusplot | Постройте состояние нелинейной оценки смешанных эффектов |
sbiofittool | Откройте рабочий стол SimBiology для подбора кривой населения |
sbiogetmodel | Получите объект модели, который сгенерировал данные моделирования |
sbiolasterror | SimBiology последнее сообщение об ошибке |
sbiolastwarning | SimBiology последнее предупреждающее сообщение |
sbioloadproject | Загрузите проект из файла |
sbiomodel | Создайте объект модели |
sbionca | Вычислите неразделенный на отсеки анализ (NCA) параметры (требует Statistics and Machine Learning Toolbox), |
sbioncaoptions | Задайте опции, чтобы вычислить неразделенный на отсеки анализ (NCA) параметры |
sbionlinfit | Выполните регрессию нелинейного метода наименьших квадратов с помощью моделей SimBiology (требует программного обеспечения Statistics and Machine Learning Toolbox), |
sbionlmefit | Оцените нелинейные смешанные эффекты с помощью моделей SimBiology (требует программного обеспечения Statistics and Machine Learning Toolbox), |
sbionlmefitsa | Оцените нелинейные смешанные эффекты со стохастическим алгоритмом EM (требует программного обеспечения Statistics and Machine Learning Toolbox), |
sbionmfiledef | Определение файла NONMEM возражает для sbionmimport |
sbionmimport | Импортируйте NONMEM-отформатированные-данные |
sbioparamestim | Выполните оценку параметра |
sbioparameterci | Вычислите доверительные интервалы для предполагаемых параметров (требует Statistics and Machine Learning Toolbox), |
sbioplot | Постройте результаты симуляции в одной фигуре |
sbiopredictionci | Вычислите доверительные интервалы для прогнозов модели (требует Statistics and Machine Learning Toolbox), |
sbioremovefromlibrary | Удалите кинетический закон, модуль или модульный префикс из библиотеки |
sbioreset | Удалите все объекты модели |
sbioroot | Возвратите корневой объект SimBiology |
sbiosampleerror | Демонстрационная ошибка на основе ошибочной модели и добавляет шум в данные моделирования |
sbiosampleparameters | Сгенерируйте параметры путем выборки ковариационной модели (требует программного обеспечения Statistics and Machine Learning Toolbox), |
sbiosaveproject | Сохраните все модели в корневом объекте |
sbioselect | Ищите объекты с заданными ограничениями |
sbioshowunitprefixes | Покажите модульные префиксы в библиотеке |
sbioshowunits | Покажите модули в библиотеке |
sbiosimulate | Модель Simulate SimBiology |
sbiosteadystate | Найдите устойчивое состояние модели SimBiology |
sbiosubplot | Постройте результаты симуляции в подграфиках |
sbiotrellis | Отобразите на графике данные или результаты симуляции в графике решетки |
sbiounit | Создайте пользовательский модуль |
sbiounitcalculator | Преобразуйте значение между модулями |
sbiounitprefix | Создайте пользовательский модульный префикс |
sbiovariant | Создайте различный объект |
sbiowhos | Покажите содержимое файла проекта, файла библиотеки или корневого объекта SimBiology |
sbmlexport | Экспортируйте модель SimBiology в файл SBML |
sbmlimport | Импортируйте SBML-отформатированный файл |
Scenarios | Сценарии симуляции |
ScheduleDose object | Задайте протокол дозирования препарата |
select (SimData) | Выберите данные из объекта SimData |
selectbyname (SimData) | Выберите данные по наименованию из объектного массива SimData |
SensitivityAnalysisOptions | Задайте опции анализа чувствительности |
set (any object) | Установите свойства объектов |
setactiveconfigset (model) | Установите активную конфигурацию модели для объекта модели |
setparameter (kineticlaw) | Задайте определенные параметры в кинетическом объекте закона |
setspecies (kineticlaw) | Задайте разновидности в кинетическом объекте закона |
setTable(ScheduleDose,RepeatDose) | Установите информацию о дозировании от таблицы до объекта дозы |
simbiology | Откройте приложение SimBiology, чтобы создать PK/PD и механистические модели системной биологии |
SimBiology.export.Dose | Экспортируемый объект дозы модели SimBiology |
SimBiology.export.ExplicitTauSimulationOptions | Настройки для явного tau-прыгающего решателя экспортируемой модели SimBiology |
SimBiology.export.ImplicitTauSimulationOptions | Настройки для неявной tau-прыгающей стохастической симуляции экспортируемой модели SimBiology |
SimBiology.export.Model | Экспортируемый объект модели SimBiology |
SimBiology.export.Model.getdose | Возвратите экспортируемый объект дозы модели SimBiology |
SimBiology.export.Model.getIndex | Получите индексы в свойства ValueInfo и InitialValues |
SimBiology.export.Model.isAccelerated | Определите, ускоряется ли экспортируемая модель SimBiology |
SimBiology.export.ODESimulationOptions | Настройки для детерминированной симуляции обыкновенного дифференциального уравнения экспортируемой модели SimBiology |
SimBiology.export.RepeatDose | Повторные дозы для экспортируемой модели SimBiology |
SimBiology.export.ScheduleDose | Запланируйте дозу для экспортируемой модели SimBiology |
SimBiology.export.SimulationOptions | Настройки симуляции для экспортируемой модели SimBiology |
SimBiology.export.StochasticSimulationOptions | Настройки для стохастической симуляции экспортируемой модели SimBiology |
SimBiology.export.ValueInfo | Модифицируемые разновидности, отсеки или параметры в экспортируемой модели SimBiology |
SimData object | Устройство хранения данных данных моделирования |
SimFunction object | Подобный функции интерфейс, чтобы выполнить модели SimBiology |
SimFunctionSensitivity object | Объект SimFunctionSensitivity, подкласс объекта SimFunction |
simulate | Симулируйте экспортируемую модель SimBiology |
SolverOptions | Задайте опции решателя модели |
Species object | Опции для разновидностей отсека |
summary(LeastSquaresResults,OptimResults,NLINResults) | Постройте итоговую фигуру, которая содержит статистика оценки и ориентировочные стоимости |
Unit object | Содержите информацию о пользовательском модуле |
UnitPrefix object | Содержите информацию о пользовательском модульном префиксе |
updateInitialAssignments | Обновите первоначальные правила присвоения удалить зависимости от порядка |
Variant object | Сохраните альтернативные значения компонента |
verify | Подтвердите и проверьте модель SimBiology |
verify (covmodel) | Проверьте ковариационную модель на наличие ошибок |