Сгенерируйте индекс с помощью Нор-Wheeler, преобразовывают
bowtiebuild(
создает индекс с помощью ссылочной последовательности (последовательностей) в input
,indexBaseName
)input
, и сохраняет его в индексный файл indexBaseName
.
Примечание
bowtiebuild
работает на Mac и платформах UNIX® только.
bowtiebuild(
задает дополнительные опции.input
,indexBaseName
,'BowtieBuildOptions',options
)
Больше информации об алгоритме Галстука-бабочки (Версия 0.12.7) может быть найдено в http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml.
Некоторые предварительно созданные индексные файлы для организмов модели могут быть загружены непосредственно с репозитория Галстука-бабочки.