Формат длинная последовательность выводится для легкого просмотра
seqdisp(Seq)
seqdisp(Seq, ...'Row', RowValue,
...)
seqdisp(Seq, ...'Column', ColumnValue,
...)
seqdisp(Seq, ...'ShowNumbers', ShowNumbersValue,
...)
Seq | Нуклеотид или последовательность аминокислот, представленная любым следующим:
Умножьтесь выровненные последовательности позволены. Файлы FASTA могут иметь расширение файла |
RowValue | Целое число, которое задает длину каждой строки. Значением по умолчанию является 60. |
ColumnValue | Целое число, которое задает ширину столбца или количество символов прежде, чем отобразить пробел. Значением по умолчанию является 10. |
ShowNumbersValue | Управляет отображением чисел в начале каждой строки. Выбором является true (значение по умолчанию), чтобы показать числа или false скрыть числа. |
seqdisp( отображает последовательность в строках, с длиной строки по умолчанию 60 и шириной столбца по умолчанию Seq)10.
seqdisp ( вызовы SeqPropertyName ', PropertyValue, ...)seqdisp с дополнительными свойствами, которые используют имя свойства / пары значения свойства. Можно задать одно или несколько свойств в любом порядке. Каждый PropertyName должен быть заключен в одинарные кавычки и нечувствительный к регистру. Это имя свойства / пары значения свойства следующие:
seqdisp( задает длину каждой строки для отображенной последовательности. Seq, ...'Row', RowValue,
...)
seqdisp( задает количество букв, чтобы отобразиться прежде, чем добавить пробел. Seq, ...'Column', ColumnValue,
...)RowValue должно быть больше, чем и равномерно делимым ColumnValue.
seqdisp( управляет отображением чисел в начале каждой строки. Выбором является Seq, ...'ShowNumbers', ShowNumbersValue,
...)true (значение по умолчанию), чтобы показать числа или false скрыть числа.
Считайте информации последовательности из базы данных GenBank®. Отобразите последовательность в строках с 50 буквами, и в строке, разделите каждые 10 букв пробелом.
mouseHEXA = getgenbank('AK080777');
seqdisp(mouseHEXA, 'Row', 50, 'Column', 10)
Создайте и сохраните файл FASTA с двумя последовательностями, и затем отобразите его.
hdr = ['Sequence A'; 'Sequence B'];
seq = ['TAGCTGRCCAAGGCCAAGCGAGCTTN';'ATCGACYGGTTCCGGTTCGCTCGAAN']
fastawrite('local.fa', hdr, seq);
seqdisp('local.fa', 'ShowNumbers', false')
ans =
>Sequence A
1 TAGCTGRCCA AGGCCAAGCG AGCTTN
>Sequence B
1 ATCGACYGGT TCCGGTTCGC TCGAAN
getgenbank | multialignread | multialignwrite | seqconsensus | seqlogo | seqprofile | seqshoworfs | seqviewer