Запишите нескольким выравнивание в файл
multialignwrite(
File
, Alignment
)
multialignwrite(..., 'Format', FormatValue
,
...)
multialignwrite(..., 'Header', HeaderValue
,
...)
multialignwrite(..., 'WriteCount', WriteCountValue
,
...)
multialignwrite(
записывает содержимое выравнивания к ClustalW ALN-отформатированный или MSF-отформатированный файл (по умолчанию).File
, Alignment
)
multialignwrite (..., '
вызовы PropertyName
', PropertyValue
, ...)multialignwrite
с дополнительными свойствами, которые используют имя свойства / пары значения свойства. Можно задать одно или несколько свойств в любом порядке. Заключите каждый PropertyName
в одинарных кавычках. Каждый PropertyName
является нечувствительным к регистру. Это имя свойства / пары значения свойства следующие:
multialignwrite(..., 'Format',
задает формат файла. FormatValue
,
...)FormatValue
может быть 'ALN'
(значение по умолчанию) или 'MSF'
.
multialignwrite(..., 'Header',
задает первую линию файла. Значение по умолчанию для HeaderValue
,
...)HeaderValue
'MATLAB multiple sequence alignment'
.
multialignwrite(..., 'WriteCount',
задает, добавить ли количества остатка в конец каждой линии. WriteCountValue
,
...)WriteCountValue
может быть true
(значение по умолчанию) или false
.
|
Выравнивание, такой, как возвращено |
|
Вектор символов или строка, задающая или имя файла или путь и имя файла для того, чтобы сохранить данные. Если вы задаете только имя файла, файл сохранен в Браузер текущей папки MATLAB®. Совет Если вы используете Ниже столбцов ClustalW ALN-отформатированный файл символы могут появиться, которые обозначают:
Для получения дополнительной информации об этих символах и группах остатков, рассмотренных сохраненными и полусохраненными, смотрите раздел 12 в “Изменениях начиная с версии 1.6” в |
|
Вектор символов или строка, которая задает формат Совет Можно также записать в MSF-отформатированный файл при помощи |
|
Вектор символов или строка, которая задает первую линию файла. Совет Используйте Значение по умолчанию: |
|
Задает, добавить ли количества остатка в конец каждой линии. Выбором является |
Используйте fastaread
функционируйте, чтобы считать p53samples.txt
, FASTA-отформатированный файл включал с программным обеспечением Bioinformatics Toolbox™, которое содержит семь сотовых антигенов опухоли p53 последовательности.
p53 = fastaread('p53samples.txt')
p53 =
7x1 struct array with fields:
Header
Sequence
Используйте multialign
функция, чтобы выровнять семь сотовых антигенов опухоли p53 последовательности.
ma = multialign(p53,'verbose',true);
Запишите выравнивание в файл с именем p53.aln
.
multialignwrite('p53.aln',ma)
fastaread
| fastawrite
| gethmmalignment
| multialign
| multialignread
| phytreewrite
| seqalignviewer
| seqconsensus
| seqdisp
| seqprofile