Преобразование фитообъекта в матрицу взаимосвязей
[Matrix, ID, Distances] = getmatrix(PhytreeObj)
[ преобразует объект phytree, Matrix, ID, Distances] = getmatrix(PhytreeObj)PhytreeObj, в логическую разреженную матрицу, Matrix, в котором 1 указывает, что узел ветви (индекс строки) соединен с его дочерним узлом (индекс столбца). Дочерний узел может быть либо другим узлом ветви, либо конечным узлом. ID является вектором столбцов строк, перечисляющих метки, которые соответствуют строкам и столбцам Matrix, причем метки от 1 до числа листьев являются конечными узлами, затем метки от числа листьев + 1 до числа листьев + количество ветвей являются узлами ветвей, а метка для последнего узла ветви также является корневым узлом. Distances является вектором столбца с одной записью для каждой ненулевой записи в Matrix пересекается по столбцам и представляет расстояние между узлом ветви и дочерним узлом.
T = phytreeread('pf00002.tree')
[MATRIX, ID, DIST] = getmatrix(T);