exponenta event banner

phytreeviewer

Визуализация, редактирование и изучение данных филогенетического дерева

Описание

пример

phytreeviewer открывает приложение «Филогенетическое дерево», позволяющее просматривать, редактировать и исследовать данные филогенетического дерева.

phytreeviewer(Tree) загружает a phytree объект Tree в приложение.

phytreeviewer(File) загружает данные из файла дерева Newick или ClustalW в приложение.

Входные аргументы

свернуть все

Филогенетическое дерево, указанное как Phytree объект, созданный с помощью функций phytree или phytreeread.

Файл в формате дерева Newick или ClustalW, указанный как вектор символов или строка, содержащая имя файла, путь и имя файла или URL-адрес, указывающий на файл.

Примеры

свернуть все

В этом примере показано, как просмотреть филогенетическое дерево.

Загрузите образец филогенетического дерева.

tr= phytreeread('pf00002.tree')
    Phylogenetic tree object with 33 leaves (32 branches)

Просмотр филогенетического дерева.

phytreeviewer(tr)

Figure Phylogenetic Tree 1 contains an axes. The axes contains 72 objects of type line.

Можно также щелкнуть Филогенетическое дерево (Phylogenetic Tree) на вкладке Приложения (Apps), чтобы открыть приложение и просмотреть объект филогенетического дерева. tr .

См. также

| | | | |

Представлен в R2012b