exponenta event banner

Браузер NGS

(Удалено) Визуализация и изучение трасс

Приложение удалено. Используйте средство просмотра геномики.

Описание

Приложение NGS Browser позволяет визуализировать и исследовать выравнивание операций чтения по ссылочной последовательности.

Вы можете:

  • Визуализация данных короткого чтения, выровненных по нуклеотидной эталонной последовательности, и сравнение нескольких наборов данных, выровненных по общей эталонной последовательности.

  • Просмотр покрытия различных областей ссылочной последовательности.

  • Исследовать качество и другие детали выровненных чтений.

  • Определение полиморфизмов и визуализация вставок и удалений.

  • Извлеките аннотации элементов относительно определенной области последовательности привязок.

NGS Browser app

Открыть приложение браузера NGS

  • MATLAB ® Toolstrip: На вкладке Приложения в разделе Вычислительная биология щелкните значок приложения.

  • командная строка MATLAB: Enter ngsbrowser.

Примеры

развернуть все

Создайте объект BioMap из файла в формате SAM.

b = BioMap('ex1.sam');

Отображение объекта в браузере NGS.

ngsbrowser(b)

Связанные примеры

Программное использование

развернуть все

ngsbrowser открывает приложение NGS Browser.

ngsbrowser(biomapObj) импортирует объект BioMap biomapObj содержит информацию о выравнивании последовательности и открывает ее в приложении.

Вопросы совместимости

развернуть все

Ошибки, начинающиеся с R2021a

Представлен в R2011b