Визуализация и интерактивное исследование биологических последовательностей
Приложение Sequence Viewer позволяет визуализировать и исследовать аминокислотные или нуклеотидные последовательности.
Вы можете:
Импорт последовательностей из баз данных NCBI или EMBL напрямую.
Просмотрите и изучите различную информацию о последовательности (такую как ORF и CDS) и базовую статистику (такую как проценты количества оснований или количества аминокислот).
Просмотрите последовательности комплемента и обратного комплемента, а также другие функции последовательности, такие как гены и экзоны.
Извлеките кодирующие белок участки нуклеотидной последовательности и экспортируйте их в рабочее пространство MATLAB ®.
Поиск характерных слов или шаблонов последовательностей с помощью регулярных выражений.
MATLAB Toolstrip: На вкладке Приложения в разделе Вычислительная биология щелкните значок приложения.
командная строка MATLAB: Enter seqviewer.
Получение последовательности из базы данных GenBank ®.
S = getgenbank('M10051');Загрузите последовательность в приложение Sequence Viewer.
seqviewer(S)
Можно также щелкнуть Просмотр последовательностей на вкладке Приложения, чтобы открыть приложение и просмотреть биологическую последовательность. S.
Закройте приложение.
seqviewer('close')