exponenta event banner

ngsbrowser

(Удалено) Открыть браузер NGS для визуализации и изучения трасс

ngsbrowser был удален. Используйте средство просмотра геномики.

Синтаксис

Описание

ngsbrowser открывает приложение NGS Browser.

ngsbrowser(bmObj) импортирует объект BioMap bmObj и открывает его в приложении NGS Browser.

Входные аргументы

свернуть все

Объект, содержащий информацию о последовательности или данные совмещения последовательности с коротким чтением, указанные как BioMap объект.

Примеры

свернуть все

Создайте объект BioMap из файла в формате SAM.

b = BioMap('ex1.sam');

Отображение объекта в браузере NGS.

ngsbrowser(b)

Совет

  • Используйте браузер NGS для сравнения выравнивания нескольких наборов данных с общей ссылочной последовательностью.

  • Используйте NGS Browser для исследования областей, представляющих интерес в короткочитаемом выравнивании, определенном различными анализами, такими как RNA-Seq, ChIP-Seq и анализ генетических вариаций.

Вопросы совместимости

развернуть все

Ошибки, начинающиеся с R2021a

Представлен в R2011b