subtree (phytree)
Экстракт филогенетического поддерева
Синтаксис
Tree2 = subtree(Tree1, Nodes)
Описание
Tree2 = subtree(Tree1, Nodes)Tree2) где новый корень является первым общим предком Nodes вектор от Tree1. Узлы в дереве индексируются следующим [1:NUMLEAVES] для листьев и как [NUMLEAVES+1:NUMLEAVES+NUMBRANCHES] для ветвей. Узлы также могут быть логическим массивом следующих размеров [NUMLEAVES+NUMBRANCHES x 1], [NUMLEAVES x 1] или [NUMBRANCHES x 1].
Примеры
Загрузите филогенетическое дерево, созданное из белкового семейства.
tr = phytreeread('pf00002.tree');Получите поддерево, которое содержит белки VIPR2 и GLR человека.
sel = getbyname(tr,{'vipr2_human','glr_human'}); sel = any(sel,2); tr = subtree(tr,sel); view(tr)
Представлено до R2006a