Объект, содержащий информацию о реакции модели
Объект реакции представляет собой реакцию, которая описывает процесс трансформации, транспорта или связывания, который изменяет один или несколько видов. Как правило, изменение представляет собой количество вида. Для примера:
Creatine + ATP <-> ADP + phosphocreatine
glucose + 2 ADP + 2 Pi -> 2 lactic acid + 2 ATP + 2 H2O
Пространства требуются до и после имен видов и стехиометрических значений.
Ссылки на страницы с описанием свойств объектов реакции см. в сводных данных свойств.
Свойства определяют характеристики объекта. Используйте get и set команды для перечисления свойств объектов и изменения их значений в командной строке. Графически можно изменить свойства объекта в графическом интерфейсе пользователя.
Примечание
Если создать новую реакцию в командной строке и не указать её название, реакция получит автоматическое имя Reaction_N, где N является положительным целым числом. N увеличений монотонно, когда вы добавляете больше реакций.
Если вы копируете реакцию, используя copyobjимя скопированной реакции генерируется путем добавления _N, где N является наименьшим целым числом, не используемым этим префиксом. Для примера, GivenName_1 копируется в GivenName_1_1.
| адресация (модель) | Создайте объект реакции и добавьте к объекту модели |
| addkineticlaw (реакция) | Создайте объект кинетического закона и добавьте к объекту реакции |
| аддпродукт (реакция) | Добавьте объект вида продукта к объекту реакции |
| аддреактант (реакция) | Добавьте объект вида в качестве реагента к объекту реакции |
| copyobj | Скопируйте объект SimBiology и его дети |
| delete | Удаление объекта SimBiology |
| display | Отображение сводных данных по объекту SimBiology |
| get | Получите свойства объекта SimBiology |
| getadjacencymatrix (модель) | Получите матрицу смежности из объекта модели |
| getstoichmatrix (модель) | Получите матрицу стехиометрии из объекта модели |
| rename | Переименуйте объект и обновите выражения |
| rmproduct (реакция) | Удалите видовой объект из продуктов объекта реакции |
| rmreactant (реакция) | Удалите видовой объект из реактивов объекта реакции |
| set | Установите свойства объекта SimBiology |
| Active | Укажите объект, используемый во время симуляции |
| KineticLaw | Покажите кинетический закон, используемый для ReactionRate |
| Name | Задайте имя объекта |
| Notes | HTML, описывающий объект SimBiology |
| Parent | Укажите родительский объект |
| Products | Массив продуктов реакции |
| Reactants | Массив реактивных реагентов |
| Reaction | Реакция объекта реакции |
| ReactionRate | Уравнение скорости реакции в объекте реакции |
| Reversible | Определите, является ли реакция обратимой или необратимой |
| Stoichiometry | Видовые коэффициенты в реакции |
| Tag | Задайте метку для объекта SimBiology |
| Type | Отобразите тип объекта SimBiology |
| UserData | Задайте данные для связи с объектом |
Определения и оценки реакций в SimBiology моделях, AbstractKineticLaw object, Configset object, KineticLaw object, Model object, Parameter
object, Root object, Rule object, Species
object
