Объект, содержащий информацию о видах
SimBiology® видовой объект представляет вид, который является химическим веществом или сущностью, участвующим в реакциях, например DNA
, ATP
, Pi
, creatine
, G-Protein
, или Mitogen-Activated Protein Kinase (MAPK)
. Количество видов может варьироваться или оставаться постоянным во время симуляции. Имя каждого вида должно быть уникальным в одном и том же отсеке, и видовой объект не может иметь такого же имени, как любой observable
объект в модели.
Чтобы добавить виды, которые участвуют в реакциях, добавьте реакцию к модели. Процесс добавления реакции к модели создает объект отделения (unnamed
) и необходимые видовые объекты.
Кроме того, создайте и добавьте объект вида к объекту-отсеку, используя addspecies
метод в командной строке.
Ссылки на страницы с описанием свойств видов см. в сводных данных свойств. Свойства определяют характеристики объекта. Используйте
и get
команды для перечисления свойств объектов и изменения их значений в командной строке. Графически можно изменить свойства объекта в графическом интерфейсе пользователя.set
addspecies (модель, отсек) | Создайте видовой объект и добавьте к отсечному объекту в объект модели |
Методы для видовых объектов
copyobj | Скопируйте объект SimBiology и его дети |
delete | Удаление объекта SimBiology |
display | Отображение сводных данных по объекту SimBiology |
findUsages (вид, параметр, отсек) | Узнайте, как вид, параметр или отсек используется в модели |
get | Получите свойства объекта SimBiology |
move | Переместите виды SimBiology или объект параметра к новому родительскому элементу |
rename | Переименуйте объект и обновите выражения |
set | Установите свойства объекта SimBiology |
Свойства для видовых объектов
Active | Укажите объект, используемый во время симуляции |
BoundaryCondition | Указать граничное условие вида |
Constant | Задайте переменное или постоянное количество видов, значение параметров или емкость отсека |
ConstantAmount | Задайте переменное или постоянное количество видов |
InitialAmount | Исходное количество видов |
InitialAmountUnits | Начальное количество видов модулей |
Name | Задайте имя объекта |
Notes | HTML, описывающий объект SimBiology |
Parent | Укажите родительский объект |
Tag | Задайте метку для объекта SimBiology |
Type | Отобразите тип объекта SimBiology |
Units | Модули для количества видов, значение параметров, емкость отсека, наблюдаемое выражение |
UserData | Задайте данные для связи с объектом |
Value | Значение вида, отсека или объекта параметра |
Compartment object
, Configset object
, KineticLaw object
, Model object
, Parameter
object
, Reaction object
, Root object
, Rule
object