Объект, содержащий информацию о видах
SimBiology® видовой объект представляет вид, который является химическим веществом или сущностью, участвующим в реакциях, например DNA, ATP, Pi, creatine, G-Protein, или Mitogen-Activated Protein Kinase (MAPK). Количество видов может варьироваться или оставаться постоянным во время симуляции. Имя каждого вида должно быть уникальным в одном и том же отсеке, и видовой объект не может иметь такого же имени, как любой observable объект в модели.
Чтобы добавить виды, которые участвуют в реакциях, добавьте реакцию к модели. Процесс добавления реакции к модели создает объект отделения (unnamed) и необходимые видовые объекты.
Кроме того, создайте и добавьте объект вида к объекту-отсеку, используя addspecies метод в командной строке.
Ссылки на страницы с описанием свойств видов см. в сводных данных свойств. Свойства определяют характеристики объекта. Используйте getset
| addspecies (модель, отсек) | Создайте видовой объект и добавьте к отсечному объекту в объект модели |
Методы для видовых объектов
| copyobj | Скопируйте объект SimBiology и его дети |
| delete | Удаление объекта SimBiology |
| display | Отображение сводных данных по объекту SimBiology |
| findUsages (вид, параметр, отсек) | Узнайте, как вид, параметр или отсек используется в модели |
| get | Получите свойства объекта SimBiology |
| move | Переместите виды SimBiology или объект параметра к новому родительскому элементу |
| rename | Переименуйте объект и обновите выражения |
| set | Установите свойства объекта SimBiology |
Свойства для видовых объектов
| Active | Укажите объект, используемый во время симуляции |
| BoundaryCondition | Указать граничное условие вида |
| Constant | Задайте переменное или постоянное количество видов, значение параметров или емкость отсека |
| ConstantAmount | Задайте переменное или постоянное количество видов |
| InitialAmount | Исходное количество видов |
| InitialAmountUnits | Начальное количество видов модулей |
| Name | Задайте имя объекта |
| Notes | HTML, описывающий объект SimBiology |
| Parent | Укажите родительский объект |
| Tag | Задайте метку для объекта SimBiology |
| Type | Отобразите тип объекта SimBiology |
| Units | Модули для количества видов, значение параметров, емкость отсека, наблюдаемое выражение |
| UserData | Задайте данные для связи с объектом |
| Value | Значение вида, отсека или объекта параметра |
Compartment object, Configset object, KineticLaw object, Model object, Parameter
object, Reaction object, Root object, Rule
object