fastainfo

Возвратите информацию о файле FASTA

Синтаксис

InfoStruct = fastainfo(File)

Описание

InfoStruct = fastainfo(File) возвращает структуру MATLAB®, содержащую итоговую информацию о FASTA-отформатированном файле.

Входные параметры

File

FASTA-отформатированный файл, заданный одним из следующего:

  • Вектор символов или строка, задающая имя файла или путь и имя файла FASTA-отформатированного файла. Если вы задаете только имя файла, тот файл должен быть на пути поиска файлов MATLAB или в текущей папке.

  • URL, указывающий на FASTA-отформатированный файл.

  • Символьный массив MATLAB, содержащий текст FASTA-отформатированного файла.

Выходные аргументы

InfoStruct

Структура MATLAB, содержащая итоговую информацию о FASTA-отформатированном файле. Структура содержит следующие поля.

Поле Описание
FilenameИмя файла.
FilePathПуть к файлу
FileModDateДата модификации файла.
FileSizeРазмер файла в байтах.
NumberOfEntries Количество записей последовательности в файле.
HeaderЕсли File содержит только одну последовательность, то это - вектор символов, содержащий информацию о заголовке из FASTA-отформатированного файла. В противном случае это поле пусто.
LengthЕсли File содержит только одну последовательность, то это - скаляр, задающий длину последовательности. В противном случае это поле пусто.

Примеры

Возвратите сводные данные содержимого файла FASTA:

info = fastainfo('p53nt.txt')

info = 

           Filename: 'p53nt.txt'
           FilePath: 'D:\2010_08_24_h11m43s32_job6027_pass\matlab\toolbox\bioinfo\biodemos'
        FileModDate: '31-Mar-2003 11:44:27'
           FileSize: 2764
    NumberOfEntries: 1
             Header: [1x94 char]
             Length: 2629

Смотрите также

| | | | | | | | |

Представленный в R2009b

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка
Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте