Можно импортировать последовательность в окно Protein Plot из командной строки MATLAB.

Можно импортировать последовательность после того, как окно Protein Plot будет открыто путем выполнения любого из следующего:

Выберите свойство из Properties выпадающее поле списка, чтобы отобразить сглаживавший график значений свойств вдоль последовательности. Можно выбрать несколько свойств из списка удержанием Shift или Ctrl при выборе свойств. Когда вы выбираете два свойства, графики отображены с помощью двух осей Y с одной осью Y слева и один справа. Для всех других выборов одного y - отображена ось. При отображении одного или двух свойств отображенные значения y являются фактическими значениями свойств. При отображении трех или больше свойств значения нормированы к области значений 0–1.

Можно получить доступ к информации о свойствах из Меню справки.

Поля Terminal Selection (N и C) позволяют вам принять решение построить только часть последовательности. По умолчанию вся последовательность построена.

Можно добавить собственные свойства путем нажатия на кнопку Add рядом со списком Properties. Это открывает диалоговое окно Property, которое позволяет вам задать значение для каждой из аминокислот. Поле Display Text позволяет вам задать текст, который будет отображен в списке Properties на основном окне Protein Plot. Можно также сохранить значения свойств в файл для будущего использования путем ввода имени файла в текстовом поле Filename.

Метод сглаживания значения по умолчанию является невзвешенным линейным скользящим средним значением с длиной окна пяти остатков. Можно изменить это путем выбора Edit > Filter Window Options. Диалоговое окно позволяет вам выбрать Window Size от 5 до остатков 29. Увеличение размера окна производит более сглаженный график. Можно изменить форму окна сглаживания путем изменения фактора Edge Weight. И можно выбрать функцию сглаживания, чтобы быть линейным скользящим средним значением, экспоненциальным скользящим средним или линейным сглаживанием Lowess.

Меню File позволяет вам импортировать последовательность, сохранить график, который вы создали к файлу фигуры, экспортируете значения данных в фигуре к переменной рабочей области или к MAT-файлу, экспортируете фигуру в нормальное Окно рисунка для настройки или распечатываете фигуру.

Меню Edit позволяет вам создать новое свойство, сбросить значения свойств к значениям по умолчанию и изменить параметры сглаживания с пунктом меню Configuration Values.

Меню View позволяет вам включить и выключить панель инструментов и добавить легенду в график.

Меню Tools позволяет вам увеличить масштаб и масштабировать из графика, к представлению Data Statistics, такому как среднее значение, минимальные и максимальные значения графика, и нормировать значения графика от 0 до 1.

Меню Help позволяет вам просмотреть этот документ и видеть ссылки для свойств последовательности, включенных с окном Protein Plot.