seqrcomplement

Вычислите противоположную комплементарную нить последовательности нуклеотида

Синтаксис

SeqRC = seqrcomplement(SeqNT)

Аргументы

SeqNT

Последовательность нуклеотида, заданная любым следующим:

Вектор символов или строка с буквами A, C, G, T, U и неоднозначные символы R, Y, K, M, S, W, B, D, H, V, N.
Вектор - строка из целых чисел из таблицы Mapping Nucleotide Integers to Letter Codes.
Структура MATLAB^®, содержащая поле Sequence, которое содержит последовательность нуклеотида, такой, как возвращено emblread, fastaread, fastqread, genbankread, getembl или getgenbank.

Описание

SeqRC = seqrcomplement(SeqNT) вычисляет противоположную комплементарную нить DNA или последовательности нуклеотида RNA. Последовательность возврата, SeqRC, читает от 3'-> 5' и находится в том же формате как SeqNT. Например, если SeqNT является вектором целых чисел, то так SeqRC.

Нуклеотид в SeqNT	Преобразовывает в этот нуклеотид в SeqRC
`A`	`T` или `U`
`C`	`G`
`G`	`C`
`T` или `U`	`A`

Примеры

Возвратите противоположное дополнение последовательности нуклеотида DNA.

s = 'ATCG'
seqrcomplement(s)

ans =
CGAT

Представлено до R2006a

Документация Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Памятка переводчика

1. Если смысл перевода понятен, то лучше оставьте как есть и не придирайтесь к словам, синонимам и тому подобному. О вкусах не спорим.

2. Не дополняйте перевод комментариями “от себя”. В исправлении не должно появляться дополнительных смыслов и комментариев, отсутствующих в оригинале. Такие правки не получится интегрировать в алгоритме автоматического перевода.

3. Сохраняйте структуру оригинального текста - например, не разбивайте одно предложение на два.

4. Не имеет смысла однотипное исправление перевода какого-то термина во всех предложениях. Исправляйте только в одном месте. Когда Вашу правку одобрят, это исправление будет алгоритмически распространено и на другие части документации.

5. По иным вопросам, например если надо исправить заблокированное для перевода слово, обратитесь к редакторам через форму технической поддержки.

Документация