exponenta event banner

Анализ и визуализация сети

Применять базовые алгоритмы теории графов к белково-белковым взаимодействиям (PPI) и другим генным сетям; просмотр сетевых связей с использованием интерактивных карт, графиков иерархии и путей

Используйте различные алгоритмы графиков для анализа генных сетей и белково-белковых взаимодействий. Представляют различные типы графиков с использованием разреженных матриц. Визуализация графиков и сетевых связей с помощью biograph объект, который позволяет вычислить положение узлов, нарисовать график и найти связи между узлами.

Функции

graphallshortestpathsПоиск всех кратчайших путей в графике
graphconncompНайти сильно или слабо связанные компоненты в графике
graphisdagИспытание циклов на направленном графике
graphisomorphismНайти изоморфизм между двумя графами
graphisspantreeОпределить, является ли дерево покрывающим деревом
graphmaxflowРассчитать максимальный расход на направленном графике
graphminspantreeНайти минимальное связующее дерево в графике
graphpred2pathПреобразовать индексы предшественника в пути
graphshortestpathРешение задачи кратчайшего пути на графике
graphtopoorderВыполнить топологический вид направленного ациклического графа
graphtraverseГрафик теодолитного хода по следующим смежным узлам

Классы

biographСоздать объект-биограф
biograph objectСтруктура данных, содержащая общие взаимосвязанные данные, используемые для реализации направленного графика

Темы

Функции теории графов

Функции теории графов в биоинформатике Toolbox™ применять базовые алгоритмы теории графов к разреженным матрицам.

Визуализация графиков

Панель инструментов биоинформатики включает функции, объекты и методы для создания, просмотра и управления графиками, такими как интерактивные карты, графики иерархии и пути.

Характерные примеры