cghcbs | Выполнить циклическую двоичную сегментацию (CBS) на основе данных сравнительной геномной гибридизации (aCGH) на основе массива |
cghfreqplot | Частота отображения изменений числа копий ДНК в нескольких образцах |
chromosomeplot | Сюжетная хромосомная идеограмма с рисунком G-banding |
gcrma | Выполнить корректировку фона, нормализацию квантилей и суммирование среднеполостных данных на уровне микрочипов Affymetrix |
gcrmabackadj | Выполните корректировку фона GC Rustive Multi-array Average (GCRMA) для данных на уровне зондов микрочипов Affymetrix с использованием информации о последовательности |
mattest | Выполните t-тест из двух образцов для оценки дифференциальной экспрессии генов из двух экспериментальных условий или фенотипов |
mafdr | Оценить положительную частоту ложного обнаружения для проверки множественных гипотез |
mavolcanoplot | Создание отношения значимости и экспрессии генов (кратное изменение) график рассеяния данных микрочипов |
mairplot | Создание графика зависимости интенсивности от коэффициента рассеяния данных микрочипов |
maboxplot | Создание рамочного графика для данных микрочипов |
maloglog | Создание графика регистрации данных микрочипов |
mapcaplot | Создание графика анализа основных компонентов (PCA) данных микрочипов |
nbintest | Непарный тест гипотез для данных подсчета с небольшими размерами выборки |
DataMatrix | Создать объект DataMatrix |
DataMatrix object | Структура данных, инкапсулирующая данные и метаданные из эксперимента с микрочипами, чтобы их можно было индексировать по идентификаторам генов или зондов и по идентификаторам образцов |
NegativeBinomialTest | Результат проверки непарной гипотезы |
