gprread

Считывание данных микрочипов из файла результатов GenePix (GPR)

Синтаксис

GPRData = gprread(File) gprread(..., 'PropertyName', PropertyValue,...) gprread(..., 'CleanColNames', CleanColNamesValue)

Аргументы

`File`	Файл с форматированием результатов GenePix ® (GPR). Введите символьный вектор или строку, указывающую имя файла или путь и имя файла.
`CleanColNamesValue`	Управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных.

Описание

GPRData = gprread(File) считывает данные результатов GenePix из File и создает структуру MATLAB ® (GPRData).

gprread(..., 'PropertyName', PropertyValue,...) определяет дополнительные свойства, используя пары имя/значение свойства.

gprread(..., 'CleanColNames', CleanColNamesValue) управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных. Файл GPR может содержать имена столбцов с пробелами и некоторые символы, которые программное обеспечение MATLAB не может использовать в именах переменных MATLAB. Если CleanColNamesValue является true, gprread возвращает имена в поле ColumnNames допустимые имена и имена переменных MATLAB, которые можно использовать в функциях. По умолчанию CleanColNamesValue является false и поле ColumnNames может содержать символы, недопустимые для имен переменных MATLAB.

Область Indices структуры содержит индексы, которые могут быть использованы для построения тепловых карт данных.

Дополнительные сведения о формате GPR см. в разделе

https://mdc.custhelp.com/app/answers/detail/a_id/18883/kw/file%20format

Функция поддерживает версии 3, 4 и 5 формата результатов GenePix.

Примеры

свернуть все

Считывание и отображение данных из файла результатов GenePix ® (GPR)

Открыть сценарий в реальном времени

В этом примере показано, как считывать и отображать данные из файла результатов GenePix ® (GPR).

Прочитайте образец файла GPR.

gprStruct = gprread('mouse_a1pd.gpr')

gprStruct = struct with fields:
         Header: [1x1 struct]
           Data: [9504x38 double]
         Blocks: [9504x1 double]
        Columns: [9504x1 double]
           Rows: [9504x1 double]
          Names: {9504x1 cell}
            IDs: {9504x1 cell}
    ColumnNames: {38x1 cell}
        Indices: [132x72 double]
          Shape: [1x1 struct]

Постройте график средней интенсивности переднего плана для канала 635 нм.

maimage(gprStruct,'F635 Median')

Figure contains an axes. The axes with title F635 Median contains 5 objects of type image, line.

См. также

Представлен до R2006a

Документация