Объект, содержащий информацию о реакции модели
Объект реакции представляет реакцию, которая описывает процесс трансформации, переноса или связывания, который изменяет один или несколько видов. Как правило, изменение представляет собой количество вида. Например:
Creatine + ATP <-> ADP + phosphocreatine
glucose + 2 ADP + 2 Pi -> 2 lactic acid + 2 ATP + 2 H2O
Пространства требуются до и после видовых названий и стехиометрических значений.
Ссылки на страницы ссылок на свойства объекта реакции см. в разделе Сводка свойств.
Свойства определяют характеристики объекта. Используйте get и set для вывода списка свойств объекта и изменения их значений в командной строке. Свойства объекта можно изменять графически в графическом интерфейсе пользователя.
Примечание
Если создать новую реакцию в командной строке и не указать ее имя, реакция получит автоматическое имя Reaction_N, где N - положительное целое число. N монотонно увеличивается по мере добавления новых реакций.
При копировании реакции с помощью copyobj, имя скопированной реакции генерируется путем добавления _N, где N - наименьшее целое число, не используемое этим префиксом. Например, GivenName_1 получает копируется в GivenName_1_1.
| адресация (модель) | Создание объекта реакции и добавление к объекту модели |
| addkineticlaw (реакция) | Создание объекта кинетического закона и добавление к объекту реакции |
| addproduct (реакция) | Добавление объекта вида продукта к объекту реакции |
| аддактант (реакция) | Добавление видового объекта в качестве реагента к реакционному объекту |
| copyobj | Копировать объект SimBiology и его нижестоящие элементы |
| удалить | Удалить объект SimBiology |
| показ | Отображение сводки объекта SimBiology |
| добраться | Получение свойств объекта SimBiology |
| getadjacencymatrix (модель) | Получение матрицы смежности из объекта модели |
| getstoichmatrix (модель) | Получение матрицы стехиометрии из объекта модели |
| переименовать | Переименование объекта и обновление выражений |
| rmproduct (реакция) | Удаление видового объекта из продуктов реакционного объекта |
| рмреагент (реакция) | Удаление видового объекта из реагентов реакционного объекта |
| набор | Задать свойства объекта SimBiology |
| Активный | Указать объект, используемый во время моделирования |
| KineticLaw | Показать кинетический закон, используемый для ReactionRate |
| Имя | Укажите имя объекта |
| Примечания | HTML-текст, описывающий объект SimBiology |
| Родитель | Указать родительский объект |
| Товары | Набор продуктов реакции |
| Реагенты | Набор реакционных реагентов |
| Реакция | Реакция объекта реакции |
| ReactionRate | Уравнение скорости реакции в объекте реакции |
| Обратимый | Укажите, является ли реакция обратимой или необратимой |
| Стехиометрия | Видовые коэффициенты в реакции |
| Тэг | Укажите метку для объекта SimBiology |
| Напечатать | Отображение типа объекта SimBiology |
| UserData | Укажите данные для связывания с объектом |
Определения и оценки реакций в моделях SimBiology, AbstractKineticLaw object, Configset object, KineticLaw object, Model object, Parameter object, Root object, Rule object, Species object