Exponenta Banner
exponenta event banner

featureNames

Класс: bioma.data.ExptData
Пакет: bioma.data

Извлечение или задание имен функций в объекте ExptData

Синтаксис

FeatNames = featureNames(EDObj)
FeatNames = featureNames(EDObj, Subset)
NewESObj = featureNames(EDObj, Subset, NewFeatNames)

Описание

FeatNames = featureNames(EDObj) возвращает массив ячеек из векторов символов, задающий все имена функций в объекте ExptData.

FeatNames = featureNames(EDObj, Subset) возвращает массив ячеек из векторов символов, задающий подмножество имен функций в объекте ExptData.

NewESObj = featureNames(EDObj, Subset, NewFeatNames) заменяет имена функций, заданные как Subset в EDObj, объект ExptData с NewFeatNames, и возвращает NewEDObj, новый объект ExptData.

Входные параметры

EDObj

Объект bioma.data.ExptData класс.

Subset

Чтобы задать подмножество имен функций в объекте ExptData, выполните одно из следующих действий:

  • Вектор символов, задающий имя функции

  • Массив ячеек из символьных векторов, задающих имена функций

  • Положительное целое число

  • Вектор положительных целых чисел

  • Логический вектор

NewFeatNames

Новые возможности для конкретных имен функций в объекте ExptData, заданные одним из следующих:

  • Числовой вектор

  • Вектор символов или массив ячеек из векторов символов

  • Вектор символов, который featureNames использует в качестве префикса для имен функций с номерами функций, добавленными к префиксу

  • Логический true или false (по умолчанию). Если true, featureNames присваивает уникальные имена функций с помощью формата Feature1, Feature2, и т.д.

Количество имен функций в NewFeatNames должно равняться количеству функций, заданному в Subset.

Выходные аргументы

FeatNames

Массив ячеек из символьных векторов, задающий все или некоторые имена функций в объекте ExptData. Имена функций - это имена строк в объектах DataMatrix объекта ExptData.

NewEDObj

Объект bioma.data.ExptData класс, возвращенный после замены определенных имен функций.

Примеры

Создайте объект ExptData, а затем получите из него имена функций:

% Import bioma.data package to make constructor functions
% available
import bioma.data.*
% Create DataMatrix object from .txt file containing 
% expression values from microarray experiment
dmObj = DataMatrix('File', 'mouseExprsData.txt');
% Construct ExptData object
EDObj = ExptData(dmObj);
% Retrieve feature names
FNames = featureNames(EDObj);

См. также

| | | |

Темы

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка