Класс: GFFAnotation
Получение уникальных имен функций из GFFAnnotation объект
Features = getFeatureNames(AnnotObj)
Features = getFeatureNames(AnnotObj)Featuresмассив ячеек из векторов символов, задающий уникальные имена функций, сопоставленные с аннотациями в AnnotObj.
|
Объект |
|
Массив ячеек из символьных векторов, задающий уникальные имена функций, сопоставленные с аннотациями в |
Создайте a GFFAnnotation объект из GFF-форматированного файла, который обеспечивается с Bioinformatics Toolbox™, а затем извлекает имена функций из объекта аннотации:
% Construct a GFFAnnotation object from a GFF file
GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff');
% Retrieve feature names for the annotation object
featureNames = getFeatureNames(GFFAnnotObj)
featureNames =
'CDS'
'exon'
'five_prime_UTR'
'gene'
'mRNA'
'miRNA'
'ncRNA'
'protein'
'pseudogene'
'pseudogenic_exon'
'pseudogenic_transcript'
'tRNA'
'three_prime_UTR'
'transposable_element_gene'getData (GFFAnnotation) | getFeatureNames (GFFAnnotation) | getIndex (GFFAnnotation) | getRange (GFFAnnotation) | getReferenceNames (GFFAnnotation) | getSubset (GFFAnnotation) | GFFAnnotation | GTFAnnotation