Класс: GFFAnotation
Извлечение области значений аннотаций из GFFAnnotation объект
Range = getRange(AnnotObj)
Range = getRange(AnnotObj)Rangeчисловой массив 1 на 2, задающий минимальное и максимальное положения в ссылочной последовательности, охватываемой аннотациями в AnnotObj.
|
Объект |
|
Числовой массив 1 на 2, задающий минимальное и максимальное положения в ссылочной последовательности, охватываемой аннотациями в |
Создайте a GFFAnnotation объект из GFF-форматированного файла, который обеспечивается с Bioinformatics Toolbox™, и затем возвращает область значений аннотаций функций:
% Construct a GFFAnnotation object from a GFF file
GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff');
% Return first and last positions of reference associated with feature annotations
range = getRange(GFFAnnotObj)
range =
3631 498516
Используйте getSubset метод с Reference Пара "имя-значение", чтобы вернуть GFFAnnotation объект, содержащий только одну ссылочную последовательность. Затем используйте этот подмножество объекта как вход в getRange способ.
getData (GFFAnnotation) | getFeatureNames (GFFAnnotation) | getIndex (GFFAnnotation) | getRange (GFFAnnotation) | getReferenceNames (GFFAnnotation) | getSubset (GFFAnnotation) | GFFAnnotation | GTFAnnotation